Banca de QUALIFICAÇÃO: JULIANA GABRIELA SILVA DE LIMA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : JULIANA GABRIELA SILVA DE LIMA
DATA : 30/07/2021
HORA: 08:00
LOCAL: Videoconferência
TÍTULO:

SEQUÊNCIAS 2A E 2A-LIKE EM VÍRUS DE RNA: IMPLICAÇÕES NA EVOLUÇÃO E COMPLEXIDADE DOS GENOMAS

PALAVRAS-CHAVES:

Sequências 2A, Pseudo 2A-like, 2A-like ranking, família Totiviridae

PÁGINAS: 65
RESUMO:

As sequências 2A/2A-like são oligopeptídeos com aproximadamente 18-22 aminoácidos caracterizados por ter um motivo C-terminal de nove aminoácidos -(G/H)₁D₂(V/I)₃E₄X₅N₆P₇G₈P₉- envolvido em um efeito de "pulo" do ribossomo durante a tradução, o qual separa duas proteínas sem a necessidade de uma proteinase. O estudo em questão objetivou identificar e caracterizar sequências 2A-like em genomas virais determinando as famílias em que esses elementos ocorrem tendo em vista as implicações dessas sequências na evolução viral e na complexidade dos genomas e sua grande aplicabilidade biotecnológica. Para isto, foram utilizadas sequências de RdRp para atualizar as relações filogenéticas da família Totiviridae através de uma análise bayesiana usando o programa BEAST v2.4, o que possibilitou a identificação de um grupo monofilético denominado de Giardiavirus expandido que é composto pelos subgrupos IMNV-like e GLV-like. Também foi utilizado o programa Foldindex para caracterização de elementos genômicos da ORF1 dos vírus pertencentes ao grupo Giardiavirus expandido. Além disso, neste estudo foi desenvolvido o software 2A-like ranking, o qual foi utilizado na identificação de sequências com alta propensão a se transformar em a 2A-likes, aqui chamadas de pseudo 2A, entre os vírus infectantes de artrópodes do grupo Giardiavirus expandido. E ao fazer a análise de sítios invariáveis das sequências 2A-like e pseudo 2A dos grupos IMNV-like e GLV-like através do programa DAMB foi possível identificar que estas sequências podem estar sofrendo seleção positiva e neutra, respectivamente. Com isso e levando em consideração a reconstrução filogenética e a existência dos pseudo 2A-like sugerimos que essas sequências podem ser percussoras para a evolução viral desta família, uma vez que, se as mesmas sofrerem alterações e tornarem-se sequências 2A-like funcionais elas podem aumentar a complexidade do genoma viral.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1513597 - JOAO PAULO MATOS SANTOS LIMA
Externo ao Programa - 1715230 - JOSELIO MARIA GALVAO DE ARAUJO
Interno - 2275890 - MARCELO DE SOUSA DA SILVA