Banca de QUALIFICAÇÃO: MÁRCIA DANIELLE DE ARAÚJO DANTAS

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : MÁRCIA DANIELLE DE ARAÚJO DANTAS
DATA : 26/02/2018
HORA: 14:00
LOCAL: Sala Carl Peter von Dietrich - Departamento de Bioquímica
TÍTULO:

Estudo dos Genomas dos Principais Vírus que Acometem a Carcinicultura do Estado do Rio Grande do Norte

PALAVRAS-CHAVES:

IMNV, WSSV, PstDNV, Filogenia, Camarão

PÁGINAS: 106
RESUMO:

A região nordeste é uma das maiores produtoras de camarão no Brasil, com destaque para os estados do Ceará e Rio Grande do Norte. Um dos maiores problemas que a indústria da carcinicultura vem enfrentando nas últimas décadas é o aumento da incidência de doenças infecciosas. Dentre essas doenças, aquelas causadas por vírus custam bilhões de dólares à carcinicultura e os impactos sociais e econômicos tem sido profundos em países onde essa atividade constitui uma indústria significante. Dentre essas doenças destacam-se aquelas causadas pelo vírus da síndrome da mancha branca (WSSV), o vírus da infecção hipodermal e necrose hematopoiética (PstDNV) e o vírus da mionecrose infecciosa (IMNV). O estudo dos genomas desses vírus é de fundamental importância para entender mecanismos essenciais à sobrevivência dos mesmos e, assim, desenvolver ferramentas eficazes para detecção e controle. Nesse contexto, o objetivo geral deste trabalho foi estudar os genomas dos vírus IMNV, WSSV e PstDNV e contribuir com novas informações sobre a biologia destes patógenos. O capítulo 1 descreve o estudo de sequências de membros da família Totiviridae. Os resultados mostram que o IMNV e outros vírus da família que infectam artrópodes apresentam características que os classificam em um novo gênero denominado Artivirus. O alinhamento de aminoácidos da ORF1 indica que os artivírus são os únicos membros da família Totiviridae que apresentam os sítios de clivagem 2A-like e duas proteínas previamente preditas para o IMNV. Um possível sítio de clivagem upstream à proteína do capsídeo também foi identificado nesses genomas. Modelos proteicos revelaram estruturas conservadas para as duas proteínas, indicando que, provavelmente, elas estão envolvidas na formação das protrusões virais e empacotamento do RNA. O capítulo 2 aborda o sequenciamento e análise do primeiro genoma de um isolado brasileiro do WSSV (WSSV-BR). O genoma foi seqüenciado utilizando a plataforma Ion Torrent e montado usando um pipeline alternativo no qual um genoma quimera do WSSV foi utilizado como sequência referência. O genoma do WSSV-BR apresentou um tamanho de 292.912 pb, 184 possíveis ORFs e nove regiões homólogas (hrs). Análises de identidade e de filogenia mostraram que o WSSV brasileiro é mais próximo aos isolados da Tailândia e México e que, provavelmente, esses três vírus compartilham uma origem evolutiva comum. Além disso, foi obervado que a história evolutiva do WSSV pode estar relacionada a eventos de recombinação e que esses eventos, de algum modo, podem ser traçados analisando as regiões homólogas do WSSV. O capítulo 3, que está em andamento, traz o sequenciamento e análise de uma possível nova variante brasileira do PstDNV (PstDNV-BR17), a qual não causa sintomas em camarões. A comparação de identidade e a análise filogenética mostraram que o novo isolado faz parte da linhagem infecciosa do PstDNV, o que foi inesperado. Análises de estrutura secundária e terciária das proteínas virais também não mostraram diferenças entre os isolados brasileiros. É possível que os camarões estejam ficando resistentes ao PstDNV. Todos esses resultados juntos contribuem para aumentar o conhecimento sobre os principais vírus que acometem a carcinicultura mundial.

MEMBROS DA BANCA:
Externo ao Programa - 1715230 - JOSELIO MARIA GALVAO DE ARAUJO
Interno - 2275890 - MARCELO DE SOUSA DA SILVA
Presidente - 1199127 - SILVIA REGINA BATISTUZZO DE MEDEIROS