BioRemPP: uma aplicação Web para identificar o potencial de bactérias, fungos e plantas para biorremediação de poluentes ambientais prioritários
biorremediação; poluentes ambientais; análise genômica;toxicologia ambiental
Biorremediação é uma abordagem sustentável para mitigar a poluição ambiental causada por atividades industriais, agrícolas e urbanas. Este estudo apresenta o BioRemPP (Bioremediation Potential Profile), uma plataforma desenvolvida para analisar dados genômicos, metabólicos, funcionais e toxicológicos relacionados ao potencial de biorremediação de bactérias, fungos e plantas na degradação de poluentes prioritários. A plataforma integra dados curados de bancos como KEGG, PubChem, ChEBI, HADEG e ToxCSM, além de informações de agências ambientais e marcos regulatórios. O BioRemPP utiliza bibliotecas Python como Pandas e NumPy para manipulação de dados, scikit-learn para reconhecimento de padrões e Matplotlib e Plotly para visualização. Construída com o framework Dash, a interface oferece uma experiência dinâmica e intuitiva para o usuário. Os dados de entrada enviados pelos usuários, estruturados como identificadores KEGG Ortholog e IDs de amostras, passam por um processamento para mapear relações com poluentes ambientais. A plataforma integra dados sobre 324 compostos e 986 genes, estabelecendo conexões entre poluentes prioritários, enzimas, vias de degradação e perfis toxicológicos. Os dados são processados em sete seções de resultados, e as saídas incluem tabelas e visualizações que detalham compostos, genes e vias metabólicas relacionados ao potencial de degradação de poluentes. Recursos interativos, incluindo 20 tipos de gráficos, permitem uma análise de dados multidimensional.