Banca de DEFESA: PRISCILA CAROLINE DE SOUSA COSTA

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : PRISCILA CAROLINE DE SOUSA COSTA
DATA : 15/12/2022
HORA: 09:00
LOCAL: Google Meet
TÍTULO:

IDENTIFICAÇÃO DE HOMÓLOGOS REMOTOS UTILIZANDO FERRAMENTAS DE ALINHAMENTO ESTRUTURAL DE PROTEÍNAS E APRENDIZADO DE MÁQUINA

PALAVRAS-CHAVES:

DUF, domínios de proteína, AlphaFold, similaridade estrutural de proteínas, FATCAT

PÁGINAS: 37
RESUMO:

Os estudos da proteômica têm mostrado o grande número de proteínas descobertas e a sua importância para o estudo da vida. Porém, ainda existe uma alta porcentagem dessas proteínas que não foram anotadas funcionalmente, limitando os avanços em diversas áreas com da saúde e de biotecnologia. As funções das proteínas são definidas pela sua conformidade e mudança da estrutura tridimensional da proteína, por isso, dados da estrutura tridimensional dessas proteínas auxiliam na definição de suas funções. Atualmente, existe uma grande quantidade e diversidade de proteínas que possuem sua sequência caracterizada, porém, ainda há um gargalo metodológico para a obtenção de seus dados estruturais. Com o recente desenvolvimento do programa AlphaFold, que prediz de forma acurada a estrutura tridimensional de proteínas a partir de sua sequência de aminoácidos, este gargalo pode ser superado. Assim, o objetivo desse projeto é avaliar o impacto do uso dessas ferramentas de predição estrutural nas anotações funcionais de proteínas. Neste trabalho, procuramos anotar funcionalmente domínios proteicos de função desconhecida (DUF). Para isso, dados preditos da sua estrutura tridimensional foram submetidos a ferramentas computacionais que realizam uma busca por outras estruturas que compartilhem similaridade estrutural. Análises preliminares demonstraram que muitos domínios podem ser beneficiados com esta análise. Além disso, geramos um modelo de classificação que identifica se duas proteínas que compartilham uma similaridade estrutural são homólogos remotos. Este classificador será utilizado futuramente para analisar os resultados de similaridade e sugerir funções a esses domínios.

MEMBROS DA BANCA:
Externo à Instituição - LUCAS BLEICHER - UFMG
Externo ao Programa - 3884005 - PATRICK CESAR ALVES TERREMATTE - nullPresidente - 3063244 - TETSU SAKAMOTO