Banca de QUALIFICAÇÃO: LEONIDAS DA SILVA BARBOSA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : LEONIDAS DA SILVA BARBOSA
DATA : 24/03/2018
HORA: 14:00
LOCAL: BioME
TÍTULO:

S-Score tools no Estudo do Câncer e Uso em Simulação do Desenvolvimento de Células Cancerígenas

PALAVRAS-CHAVES:

Cancer. SKCM. S-Score. Análise de dados. Simulação em câncer.

PÁGINAS: 33
RESUMO:

O câncer se caracteriza por ser uma doença dinâmica e sistêmica que afeta milhares de pessoas ao redor do mundo. Dentre os vários fatores que estão relacionados com o seu desenvolvimento destacam-se as mutações do tipo somáticas, que conferem vantagens na seletividade clonal e estão casualmente ligados a oncogênese. Esse tipo de mutação corresponde as interseções, deleções e rearranjos dos genes e são conhecidas como mutações drivers. Tais mutações são subvididades em dois grupos: oncogênicas e supressoras. Com o intuito de melhor estudar esta doença diferentes abordagens são encontradas na literatura. Explorar os dados gerados por sequenciadores de segunda geração é uma destas. Porém, embora o conjunto de dados gerados seja expressivo, fazem-se necessárias boas metodologias para se exaurir os dados gerados. Aqui neste trabalho, uma ferramenta denominada sscore-tools utilizando-se da metodologia desenvolvida pelo S-Score, que tenta inferir a potencialidade de um gene ser oncogênico ou supressor, foi implementada e optimizada com a finalidade de explorar os dados públicos do TCGA em uma abordagem em largura e em profundidade. Foi escolhido o câncer de pele (SKCM) para análise dos dados gerados pela ferramenta onde através do cruzamento dos dados de S-Score de vários tecidos contra SKCM foi possível observar genes comuns com características similares nos valores de S-Score com potencialidade oncogênica e supressora ligada aos tecidos analisados. Na segunda parte deste trabalho intenta-se utilizar dos dados gerados por esta ferramenta no estudo de progressão de células tumorais e outras simulações envolvendo a metodologia do S-Score.  

MEMBROS DA BANCA:
Externo ao Programa - 1365498 - BEATRIZ STRANSKY FERREIRA
Presidente - 2276280 - CESAR RENNO COSTA
Interno - 2170415 - JORGE ESTEFANO SANTANA DE SOUZA