Banca de QUALIFICAÇÃO: SAMARA BEATRIZ DE ABREU PINTO

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : SAMARA BEATRIZ DE ABREU PINTO
DATA : 30/09/2026
HORA: 10:00
LOCAL: VIDEOCONFERÊNCIA
TÍTULO:

LEISHMOLDB: INTEGRAÇÃO DE MÉTODOS COMPUTACIONAIS PARA ANÁLISE TRIDIMENSIONAL E DESCOBERTA DE FÁRMACOS

PALAVRAS-CHAVES:

leishmaniose; quimioinformática; similaridade molecular; triagem virtual baseada em ligantes; química medicinal.

PÁGINAS: 106
RESUMO:

A leishmaniose permanece como uma importante doença tropical negligenciada, cuja terapêutica ainda apresenta limitações relacionadas à toxicidade, resistência parasitária, regimes prolongados de administração e disponibilidade restrita de opções farmacológicas. Nesse contexto, ferramentas de quimioinformática podem contribuir para a organização, análise e exploração de informações químicas relacionadas a compostos com atividade antileishmania. Este trabalho teve como objetivo aprimorar e expandir o LeishMolDB, uma plataforma computacional especializada em compostos testados contra formas amastigotas de Leishmania, desenvolvida para apoiar estudos de química medicinal e a exploração do espaço químico antileishmania, integrando uma coleção continuamente curada com mais de 1.000 estruturas moleculares e suas respectivas informações bibliográficas, permitindo a consulta de compostos, cálculo e visualização de descritores físico químicos, aplicação de alertas estruturais, inspeção molecular bidimensional e tridimensional e análise de relações de similaridade. A plataforma utiliza fingerprints de Morgan e coeficiente de Tanimoto para buscas baseadas em conectividade molecular e incorpora ferramentas de comparação tridimensional para ampliar a exploração de relações estruturais que não são diretamente representadas por descritores bidimensionais. A visualização das estruturas é realizada de forma interativa por meio da biblioteca 3Dmol.js, enquanto a integração com Cytoscape.js permite a exploração do acervo por meio de uma Rede de Similaridade Molecular. Também foram incorporados recursos de apoio à interpretação dos resultados, incluindo propriedades relacionadas à Regra dos Cinco de Lipinski, área de superfície polar topológica e alertas para compostos de interferência em ensaios biológicos. Como parte do processo de desenvolvimento do módulo tridimensional do LeishMolDB, foi realizada uma avaliação retrospectiva destinada a comparar diferentes estratégias de análise 3D e fornecer suporte metodológico ao refinamento desse fluxo. Para isso, foram avaliados protocolos de alinhamento baseados em LS align e O3A, considerando abordagens rígidas e flexíveis, enquanto o SHAFTS foi empregado como comparador tridimensional externo. A busca por Morgan/Tanimoto foi mantida como referência topológica e como uma funcionalidade independente da plataforma, não sendo tratada como concorrente direta das abordagens tridimensionais. A avaliação permitiu caracterizar o comportamento dos diferentes métodos de alinhamento 3D em condições controladas e orientar o refinamento metodológico no sistema, além de reforçar a utilização de abordagens complementares de similaridade molecular na plataforma, preservando a busca rápida baseada em conectividade e a exploração tridimensional como ferramentas destinadas a responder a diferentes tipos de relações estruturais. Dessa forma, o LeishMolDB constitui uma plataforma integrada para curadoria, consulta, visualização e análise de compostos antileishmania, reunindo em um único ambiente recursos de quimioinformática, triagem virtual baseada em ligantes e exploração do espaço químico, fornecendo uma infraestrutura computacional voltada ao apoio à pesquisa em química medicinal e à priorização de moléculas para investigações posteriores relacionadas à descoberta de novos agentes antileishmania. A plataforma está disponível gratuitamente em: https://bioinfo.imd.ufrn.br/LeishMoIDB/.

MEMBROS DA BANCA:
Externo à Instituição - FRANCO HENRIQUE ANDRADE LEITE - UEFS
Presidente - 2378605 - CRISTIANE FERNANDES DE ASSIS
Externo à Instituição - JOÃO XAVIER DE ARAÚJO JÚNIOR - UFAL