Identificação do Trypanosoma cruzi por amplificação do DNA com novos iniciadores na Reação em Cadeia da Polimerase (PCR)
Trypanosoma cruzi. diagnóstico molecular. 18S. COX II. NADH 1. NADH 5.
A doença de Chagas (DC) é uma infecção parasitária causada pelo protozoário
flagelado Trypanosoma cruzi. O diagnóstico da fase crônica da doença de Chagas é
realizado, principalmente, por meio de testes sorológicos, que detectam anticorpos
específicos anti-T.cruzi. No entanto, resultados inconclusivos ou falsos positivos, são
recorrentes, sobretudo devido às reações cruzadas com outros tripanosomatídeos.
Desta forma, os avanços na biologia molecular são responsáveis por melhorar
significativamente o diagnóstico da infecção. O objetivo deste estudo foi a
identificação do T. cruzi de diferentes DTUs por amplificação do DNA com novos
iniciadores na Reação em Cadeia da Polimerase (PCR). O desenho dos iniciadores
foi baseado nas sequências de DNA das cepas, clones e isolados de referência de T.
cruzi, depositadas no GenBank do NCBI para os genes do kDNA: 9S, 18S, Citocromo
B, Citocromo Oxidase subunidade II (COX II), NADH desidrogenase subunidade 1
(NADH 1) e NADH desidrogenase subunidade 5 (NADH 5). Os iniciadores foram
desenhados no software Primer Blast NCBI. Após checagem manual e testes in silico,
os iniciadores mais promissores, desenhados para o gene do 18S (5’ –
CAAGCGGCTGGGTGGTTATT – 3’ e 3’ – CACGGATTTCCCACAAAGGC – 5’)
produziram um fragmento de 104pb, COX II (5’ – TGTTATCCATTCATTTACGTTAGC
– 3’ e 3’ – CATAACTCGCTGCATTGC – 5’) produziram um fragmento de 122pb,
NADH 1 (5’
–
AAGTCCAGCAACCAATTCACTT
–
3’
e 3’
–
CGTTACTCTGTGATGGCTTGA – 5’) formaram uma banda de 71pb e NADH 5 (5’ –
AGAGTACACAGTTTGGGTTG – 3’ e 3’ – CCACATACAACTAACGTTGC – 5’), que
produziu uma banda de 100pb foram selecionados para o estudo. Inicialmente, as
condições da PCR foram testadas para os quatro pares de iniciadores escolhidos e
foram definidas as temperaturas de anelamento de 60ºC (18S), 48ºC (COX II), 57ºC
(NADH 1) e 55ºC (NADH 5). Em seguida, o teste de sensibilidade analítica foi
realizado com diferentes DTUs, concentrações de DNA e quantidade de parasitos. Os
iniciadores desenhados para o 18S detectaram o parasito nas concentrações de
1000fg até 0,1fg em TcI (Col 1.7), de 1000fg até 1fg na TcII (Y) e 1000fg até 10fg na
TcIII (CBS56). A sensibilidade analítica da concentração de parasitos na amostra de
sangue revelou que os iniciadores do 18S conseguiram detectar o DNA do T. cruzi,
nas concentrações de 1000p/mL em amostras de TcI e TcII; e de 10pmL até 1000p/mL
em TcIII. A PCR do COXII não alcançou padronização adequada. Os iniciadores
utilizados para a PCR do NADH 1 e NADH 5 não foram capazes de detectar todas as
DTUs testadas. A identificação do T. cruzi foi pouco eficiente em amostras de sangue
humano, de animais domesticados como Canis familiaris, Ovis aries e Capra hircus e
o DNA parasito foi identificado em todas as amostras T. cruzi de cultura de conteúdo
intestinal de triatomíneos.