Banca de QUALIFICAÇÃO: THAIS TEIXEIRA OLIVEIRA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : THAIS TEIXEIRA OLIVEIRA
DATA : 28/09/2023
HORA: 09:00
LOCAL: Google Meet (https://meet.google.com/mog-ocfv-hbw)
TÍTULO:

Assinatura molecular da COVID-19: análise integrada de conjuntos de dados de RNA-seq revela novos alvos e reguladores transcricionais associados à gravidade da doença.

PALAVRAS-CHAVES:

A DEFINIR

PÁGINAS: 90
RESUMO:

Durante a pandemia por COVID-19, vários conjuntos de dados de RNA-seq foram produzidos com o objetivo de investigar a resposta celular ao SARS-CoV-2, descobrir possíveis alvos de drogas e elucidar a relação vírus-hospedeiro. No entanto, muitos desses dados permanecem subutilizados e alguns podem possuir um número limitado de participantes. Para melhorar a busca por alvos moleculares e biomarcadores, este trabalho realizou uma análise integrada de vários conjuntos de dados de RNA-seq. Esta análise possibilitou o aumento do número de pacientes avaliados, aumentando a confiabilidade dos dados. Considerando também a variabilidade genética incluindo pacientes de diferentes origens. Este trabalho se concentra na análise de conjuntos de dados de pacientes com COVID-19 grave e leve para identificar possíveis alvos ou vias associadas à progressão da doença e descobrir biomarcadores de gravidade. Foram analisados três conjuntos de dados de sangue total e um conjunto de dados de amostras de leucócitos de pacientes na unidade de terapia intensiva (UTI) comparando-os com pacientes de UTI porém negativos para COVID-19. Além disso, dados de swab nasal e PBMC também foram analisados. Como resultado, foi identificado que pacientes graves com COVID-19 exibem superexpressão de genes que codificam proteínas de exossomos extracelulares, proteínas do sistema endomembranar e grânulos de neutrófilos. Além disso, foram destacados alvos-chave como S100A9, LY96, CDC42 e RAB1B, que podem desempenhar um papel importante na resposta celular à infecção. Por outro lado, pacientes com COVID-19 grave apresentam regulação negativa de genes que codificam componentes do complexo receptor de células T e proteínas do nucléolo, incluindo TP53, IL2RB e NCL. Finalmente, a análise dos principais reguladores mostrou que o SPI1 é um fator de transcrição associado aos genes upregulated e TP53, MYC e MAX têm um papel essencial na regulação da expressão de downregulated durante o COVID-19. Este trabalho identificou alvos importantes que podem provocar insights sobre a compreensão da fisiopatologia molecular da infecção por SARS-CoV-2. Além disso, a identificação de fatores transcricionais que regulam a expressão de genes envolvidos na infecção e na resposta inflamatória pode ser fundamental para o avanço da compreensão da doença.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 2087759 - ANDRE DUCATI LUCHESSI
Externa ao Programa - 1346635 - JANEUSA TRINDADE DE SOUTO - UFRNExterno ao Programa - 2170415 - Jorge Estefano de Santana Souza - UFRN