Banca de QUALIFICAÇÃO: JÉSSICA NAYARA GÓES DE ARAÚJO

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : JÉSSICA NAYARA GÓES DE ARAÚJO
DATA : 24/03/2022
HORA: 13:30
LOCAL: https://meet.google.com/vsm-wdgw-nev
TÍTULO:

Identificação e caracterização funcional de variantes genéticas regulatórias da expressão gênica na Hipercolesterolemia Familiar

PALAVRAS-CHAVES:

Hipercolesterolemia familiar; variante regulatória; análise de bioinformática; sequenciamento de nova geração; LDLR; APOB; PCSK9.

PÁGINAS: 71
RESUMO:

A hipercolesterolemia familiar (HF) é um distúrbio hereditário do metabolismo do colesterol, caracterizado por exposição prolongada a concentrações séricas elevadas do colesterol de lipoproteína de baixa densidade (LDL-c), que leva ao aumento significativo do risco de morbidade cardiovascular e mortalidade precoce. A principal causa da HF são variantes encontradas nos genes envolvidos na via de captação de LDL da circulação sanguínea (LDLR, APOB e PCSK9), contudo, as variantes causais não são encontradas em uma parcela significativa de indivíduos diagnosticados clinicamente. De forma que, variantes em regiões não codificantes, que não costumam ser incluídas nos painéis de diagnóstico, poderiam estar influenciando a expressão desses genes e contribuindo para o fenótipo. O presente estudo objetiva identificar variantes genéticas nas regiões upstream/promotora dos genes LDLR, APOB e PCSK9 em indivíduos diagnosticados clinicamente com HF, mas sem diagnóstico molecular confirmatório. 25 voluntários foram selecionados para sequenciamento direcionado de regiões 3 kb upstream (Chr19:11086362-11089361; Chr2:21044074-21047073; Chr1:55036476-55039475 - GRCh38) usando a metodologia AmpliSeq for Illumina. A análise computacional dos resultados do sequenciamento identificou 34 variantes de um único nucleotídeo (SNV) aprovadas no filtro de qualidade (6 no LDLR, 15 no APOB e 13 no PCSK9). 5 variantes foram priorizadas como potencialmente regulatórias (rs36218923 e rs538300761 no LDLR; rs934197 e rs9282606 no APOB, g.55038486A>G no PCSK9), conforme evidências encontradas em bancos de dados públicos, ferramentas online de anotação e predição dos efeitos das variantes e literatura que sugerisse possível influência na regulação gênica. Apenas a rs934197, apresentou maior escore de probabilidade regulatória e já foi previamente descrita como funcional. Assim, as próximas etapas deste estudo incluem a realização de ensaios de gene repórter da luciferase para confirmação do papel regulatório observado nas análises in silico.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 2085604 - SUSANA MARGARIDA GOMES MOREIRA
Externo à Instituição - MARCELO ARRUDA NAKAZONE
Externo à Instituição - MARCELO ALEX DE CARVALHO - INCA