Diversidade beta, eDNA, FMA, Fatores ambientais, Glomalina.

A caracterização da diversidade fúngica por meio do metabarcoding exige padronização na aplicação de fluxos de trabalho para evitar vieses metodológicos e gerar dados confiáveis e reprodutíveis. Nesse contexto, esta pesquisa propõe, inicialmente, um guia introdutório de boas práticas para o metabarcoding de fungos em geral, abordando etapas críticas que vão desde o delineamento amostral e extração de DNA até a escolha de barcodes e análises estatísticas. De forma complementar, o estudo afunila seu foco para os Fungos Micorrízicos Arbusculares (FMA), com detalhes metodológicos desse grupo e introduzindo o ALMA, um pipeline bioinformático automatizado, desenvolvido exclusivamente para maximizar a precisão da classificação taxonômica de Glomeromycota via posicionamento filogenético. De forma aplicada, o pipeline foi utilizado e validado no segundo capítulo, que investigou os impactos da conversão da floresta amazônica em áreas agrícolas sobre as comunidades de FMA e a dinâmica da glomalina (GRSP) no Arco do Desmatamento (Mato Grosso, Brasil). Combinando análises morfológicas e metabarcoding (eDNA), o estudo registrou uma completa reorganização taxonômica (turnover de espécies) em vez de perda de biodiversidade. Ao todo, foram identificados 128 táxons: a abordagem morfológica detectou 75 morfoespécies (39 na floresta e 58 na lavoura), enquanto o metabarcoding identificou 61 OTUs (41 na floresta e 41 na lavoura). O manejo agrícola homogeneizou o ambiente, aumentando o pH e os nutrientes do solo, o que provocou uma transição funcional de guildas: estratégias ruderais (Glomerales) dominantes na floresta deram lugar a táxons tolerantes ao estresse (Acaulosporaceae) e competitivos (Gigasporales) na lavoura. Além disso, a área agrícola exibiu uma intensa esporulação induzida pelo distúrbio e um acoplamento funcional entre a comunidade de FMA e o acúmulo de glomalina, auxiliando na estabilização do carbono orgânico do solo. Demonstrando que, embora a agricultura intensiva desestruture as redes ecológicas da floresta, esse impacto seleciona linhagens de FMA mais tolerantes ao estresse contínuo, evidenciando a capacidade de reorganização biológica do solo como um mecanismo de resiliência frente à degradação. Por fim, o trabalho contribuiu significativamente com novos registros de espécies para a Amazônia legal, aumentando a riqueza para 161 espécies, 135 no contexto da Amazônia brasileira, e contribuiu para 20 novos registros para a funga nacional.