Banca de QUALIFICAÇÃO: JOAO VICTOR VILLAS BOAS SPELTA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : JOAO VICTOR VILLAS BOAS SPELTA
DATA : 04/03/2024
HORA: 16:00
LOCAL: Google Meet, meet.google.com/eqe-fijh-ise
TÍTULO:

PREDIÇÃO GÊNICA RELACIONADA A DETERMINAÇÃO SEXUAL EM CARICA PAPAYA (CARICACEAE)

PALAVRAS-CHAVES:

hermafrodita; GWAS; genoma

PÁGINAS: 30
RESUMO:

O mamão (Carica papaya) produz um dos frutos mais consumidos ao redor do mundo. O comércio do mamão se utiliza de plantas gino-dióicas e que necessita, para que seu cultivo seja mais eficiente, onde necessita de uma maior proporção de plantas hermafroditas, tendo em vista que os frutos oriundos de mamoeiros fêmeas e machos são preteridos pelos mercados  consumidores. As sementes disponíveis no mercado geram plantas dos três tipos, macho, fêmea e hermafroditas, e a ausência de estratégias além de marcadores moleculares ainda representa uma limitação na produção do mamão. Conhecer as bases moleculares que influenciam no mecanismo de determinação sexual em mamoeiros pode auxiliar na elaboração de estratégias que auxiliem na seleção de plantas hermafroditas. Neste trabalho, procurou-se usar uma estratégia em bioinformática para abordar o tema. Realizou-se então um estudo de associação entre genótipos e fenótipos para encontrar possíveis fatores genéticos envolvidos na determinação sexual utilizando dados de resequenciamento de 36 amostras de mamão (24 machos e 12 hermafroditas) obtidos em bancos de dados públicos. Após a chamada de variantes realizada no bcftools, encontrou-se 136.916 variantes, restando 41.375 após as filtragens. Foi então realizados estudos de associação utilizando o programa PLINK com essas variantes e dentre essas, 159 das mais significativas foram submetidas ao SnpEff, retornando 767 efeitos, entre eles, 751 com nível de impacto modificador, 7 com impacto leve e 9 de efeito moderado. Realizou-se blastps com as sequências dos genes que tiveram efeito moderado e leve e seus resultados registrados. Comparou-se com o que já foi realizado na literatura e conclui-se que os resultados até então obtidos constituem um ponto de partida para estudos mais aprofundados para progredir no entendimento dos mecanismos moleculares da determinação sexual em C. papaya.

MEMBROS DA BANCA:
Externo ao Programa - 2257836 - PAULO SERGIO MARINHO LUCIO - nullPresidente - 3063244 - TETSU SAKAMOTO
Externa ao Programa - 3330361 - VASILIKI LAGOU - null