Banca de QUALIFICAÇÃO: MATHEUS MIGUEL SOARES DE MEDEIROS LIMA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : MATHEUS MIGUEL SOARES DE MEDEIROS LIMA
DATA : 01/03/2024
HORA: 10:00
LOCAL: Google Meet, meet.google.com/jks-byue-kwf
TÍTULO:

Investigação de divergências taxonômicas entre genomas de E. casseliflavus em bancos públicos

PALAVRAS-CHAVES:

Enterococcus casseliflavus; Enterococcus flavescens; genomica comparativa; taxonomia

PÁGINAS: 42
RESUMO:

Enterococcus casseliflavus, uma bactéria comumente móvel e de coloração amarela, é um membro comensal do trato gastrointestinal. Ela é ocasionalmente encontrada em casos de bacteremia e outras infecções humanas. Uma preocupação é que todas as cepas dessa espécie possuem o grupo de genes VanC em seu cromossomo, o que lhes confere resistência à vancomicina. A classificação de E. casseliflavus é desafiadora, pois apresenta 99% de identidade na análise 16S com E. gallinarum e, principalmente, com E. flavescens, sendo frequentemente classificadas como uma única espécie. Este estudo visou desenvolver um pipeline para investigar a relação filogenética entre E. casseliflavus e E. flavescens. Foi criado um pipeline de análise que integra medidas de Identidade Média de Nucleotídeos (ANI), filogenia molecular e perfil protéico. Foram analisados 85 genomas de E. casseliflavus do NCBI, comparando-os com os genomas de referência de E. casseliflavus e E. flavescens. Os resultados indicaram diferenças ANI superiores a 5%, sugerindo que E. flavescens seja considerada uma espécie distinta. Além disso, foi identificado um terceiro clado de genomas, possivelmente representando uma nova espécie de enterococos. A análise do pangenoma revelou cerca de 19 mil genes, com 1154 genes core presentes em todas as espécies, indicando um pangenoma aberto. A filogenia de genes core confirmou a divisão dos genomas em três grupos, corroborada pela análise de grupos de ortólogos de proteínas. O perfil proteico indicou possíveis eventos de transferência horizontal de genes entre os grupos, com E. casseliflavus se mostrando ligeiramente mais distante dos outros dois grupos. A análise de topologias das árvores filogenéticas revelou predominantemente monofilia nos grupos, mas também eventos de transferência horizontal gênica. Este estudo contribui significativamente para o entendimento genômico e evolutivo de E. casseliflavus e E. flavescens. Ressalta- se a necessidade contínua de investigação para compreender as diferenças no conteúdo gênico e sua funcionalidade, bem como identificar genes associados à especiação dessas espécies. Essas descobertas têm implicações importantes para o diagnóstico e manejo de infecções relacionadas à enterococos resistentes à vancomicina.

MEMBROS DA BANCA:
Externa à Instituição - FLÁVIA FIGUEIRA ABURJAILE - UFMG
Interna - 1149647 - LUCYMARA FASSARELLA AGNEZ LIMA
Presidente - 3063244 - TETSU SAKAMOTO