Banca de QUALIFICAÇÃO: VICTOR MONTENEGRO MARCELINO

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : VICTOR MONTENEGRO MARCELINO
DATA : 15/02/2024
HORA: 09:00
LOCAL: Google Meet, https://meet.google.com/sqz-yftn-prp
TÍTULO:

Evolução de enzimas modificadoras de RNA em Archaea

PALAVRAS-CHAVES:

Epitrancriptômica; Archaea; enzima modificadora de RNA; NAD-capping

PÁGINAS: 55
RESUMO:

As enzimas modificadoras de RNA são catalisadores biológicos que realizam modificações covalentes no RNA. Essas modificações são essenciais para muitos processos celulares, incluindo a estabilização e formação de estruturas secundárias em tRNAs e mRNAs, splicing e "capping" de mRNAs, tradução de proteínas e regulação da expressão gênica. Estas enzimas estão presentes nos três domínios da vida (Bacteria, Archaea e Eukarya), porém, suas histórias evolutivas são pouco conhecidas. Eucariotos derivam da fusão entre Archaea e Bacteria, e recentemente se identificou um grupo de organismos pertencentes ao domínio Archeae que são os parentes vivos mais próximos de Eukarya, denominados de Asgard, o que trouxe novos indícios de como a evolução eucariótica pode ter ocorrido. Neste trabalho tentamos explorar a história evolutiva das enzimas modificadoras de RNA com a relação filogenética entre Archaea e Eukarya. Como exemplo da interação dessas histórias evolutivas, recentemente se investigou em Archaea as enzimas modificadoras de RNA do tipo NAD-"capping", que já haviam sido descritas previamente em bactérias e eucariotos. Para tanto, foram analisados dados de sequências de proteínas do banco de dados Modomics. A análise revelou que as enzimas modificadoras de RNA e as informações presentes em Archaea são escassas. Das enzimas disponíveis no Modomics, selecionamos caracterizar as proteínas NAD-"capping" pertencentes à superfamília NUDIX. Dentre as proteínas estudadas estão as proteínas NudE de Archaea, que são responsáveis pelo “decapping" de RNA, que apresentam uma nova função em ambientes extremos. Essas proteínas foram descritas como realizando “decapping" de RNA contendo ADPR, um análogo do NAD que é facilmente degradado em ambientes extremos. Os dados obtidos nesse projeto indicam que a mudança de função pode ter ocorrido por exaptação molecular, ou seja, a cooptação de uma função preexistente para uma nova função. Para melhor entender esse processo, foram utilizadas ferramentas para se caracterizar a arquitetura de domínios presentes nas proteínas e se analisar agrupamentos e sobreposição estruturais tanto para NudE como para outras proteínas NUDIX. Foi observado que estas apresentam composição de domínios semelhantes e alta similaridade estrutural, o que pode indicar que as proteínas sob estudo apresentam funções semelhantes ou exaptação molecular. No entanto, estudos filogenéticos e de ancoragem ou docagem molecular precisam ser realizados para melhor entender esse cenário.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1513597 - JOAO PAULO MATOS SANTOS LIMA
Interno - 3063244 - TETSU SAKAMOTO