Análise proteogenômica de Mycobacterium tuberculosis através de abordagens in silico
Proteogenômica. Espectrometria de massas. Mycobacterium tuberculosis.
A proteogenômica é a área que alberga o meio entre a genômica e a proteômica. Estudos comparativos de microrganismos podem determinar mudanças estruturais e de composição através da análise direcionada de seus compostos. A bactéria Mycobacterium tuberculosis causa, principalmente, a patologia chamada de tuberculose pulmonar, e permanece sendo um dos microrganismos de maior relevância clínica no estudo de novos tratamentos contra a doença. Além disso, há diversos estudos na área de bioinformática que buscam mudanças gênicas e proteicas que possibilitem a compreensão acerca dos fatores de virulência e de resistência a fármacos. Por isso, o objetivo deste trabalho é realizar uma meta-análise comparativa de dados de espectrometria de massas de vinte laboratórios diferentes, em que será analisado o proteoma de Mycobacterium tuberculosis da linhagem H37Rv com outras linhagens. Para tanto, tal metodologia será baseada em abordagens in sílico, especialmente com o software MaxQuant e o uso de um banco de dados específico da bactéria de interesse. A partir do estudo se espera realizar a quantificação de proteínas identificadas e criar um grupo único de proteínas e amostras para validar dados de todos os proteomas selecionados.