Banca de DEFESA: THAÍS DE ALMEIDA RATIS RAMOS

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : THAÍS DE ALMEIDA RATIS RAMOS
DATA : 02/08/2022
HORA: 15:00
LOCAL: https://meet.google.com/obp-nxfb-gmo
TÍTULO:

Caracterização computacional de RNAs não codificantes longos a nível unicelular associados com o desenvolvimento do tecido cardíaco e com doenças cardiovasculares

PALAVRAS-CHAVES:

RNAs não codificantes longos, Single cell, Desenvolvimento do coração, Doenças cardiovasculares, Aprendizagem de máquina, Subpopulações de cardiomiócito.

PÁGINAS: 133
RESUMO:

Os RNAs longos não codificantes (lncRNAs) compreendem as unidades transcricionais mais representativas do genoma dos mamíferos e estão associados ao desenvolvimento de órgãos que podem estar associados ao surgimento de doenças, como as cardiovasculares. A Organização Mundial da Saúde (do inglês, World Health Organization (WHO)), por exemplo, publicou que as doenças cardiovasculares são responsáveis pela morte de 17,9 milhões de pessoas a cada ano, correspondendo a 31% de todas as mortes em todo o mundo. Sendo assim, foi utilizado uma combinação dos transcritos das bases de dados Gencode (M20), Ensembl (GRCm38.95) e Amaral et al (2018) para definir o conjunto de lncRNAs de referência não redundantes; e Gencode (M20) para os transcritos codificantes de referência. Além disso, foram utilizadas abordagens de bioinformática, algoritmos de aprendizado de máquina e técnicas estatísticas para definir lncRNAs envolvidos no desenvolvimento cardíaco de mamíferos. Para isso, foi utilizado a base dados de single-cell publicada por DeLaughter et al (2016), no qual havia dados de 4 estágios embrionários (E9.5, E11.5, E14.5, E18.5) e 4 estágios pós-natais (P0, P3, P7, P21) do organismo modelo mus musculus. Neste trabalho identificamos 8 tipos celulares distintos, novos transcritos marcadores (codificantes e diferentes tipos de lncRNAs) e também, expressão diferencial e análise de enriquecimento funcional revelaram subpopulações de cardiomiócitos associadas à função cardíaca; enquanto isso, a análise de co-expressão modular revelou insights funcionais específicos de células para lncRNAs durante o desenvolvimento do miocárdio, incluindo uma potencial associação com genes-chave relacionados à doença e ao “programa de genes fetais”. Nossos resultados evidenciam o papel de lncRNAs particulares no desenvolvimento do coração e destacam o uso de abordagens modulares de co-expressão na definição funcional do tipo de célula. Como trabalho futuro, pretende- se identificar os papéis funcionais desses RNAs no desenvolvimento de tecidos cardíacos e em doenças cardiovasculares utilizando abordagens de validação experimental.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - ***.739.204-** - VINICIUS RAMOS HENRIQUES MARACAJA COUTINHO - USP
Interno - 1507794 - RODRIGO JULIANI SIQUEIRA DALMOLIN
Interna - ***.117.554-** - THAIS GAUDENCIO DO REGO - UFPB
Externo à Instituição - GILDERLANIO SANTANA DE ARAÚJO - UFPA
Externo à Instituição - YURI DE ALMEIDA MALHEIROS BARBOSA