Banca de DEFESA: ANA CAROLINA MIRANDA FERNANDES COÊLHO
Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.DISCENTE : ANA CAROLINA MIRANDA FERNANDES COÊLHO
DATA : 18/04/2019
HORA: 13:30
LOCAL: BioME - PPg-Bioinfo
TÍTULO:
neoANT-HILL: uma ferramenta integrada para a detecção de potenciais neoantígenos
PALAVRAS-CHAVES:
neoantígenos; câncer; mutações somáticas; células T; moléculas de HLA; análises imunogenômicas.
PÁGINAS: 50
RESUMO:
Nos últimos anos, os neoantígenos têm gerado grande interesse na imunoterapia devido à sua capacidade de elicitar respostas imunológicas antitumorais. Os neoantígenos surgem como consequências de mutações somáticas especificas e podem ser apresentados, pelas moléculas de HLA, na superfície das células tumorais e reconhecidos pelas células T como moléculas não-próprias. Diversos estudos indicaram resultados promissores quanto ao uso dos neoantígenos em diferentes abordagens imunoterapêuticas. No entanto, a identificação precisa dos neoantígenos ainda permanece um desafio. Portanto, o objetivo do presente trabalho foi desenvolver uma ferramenta computacional que integre análises imunogenômicas individuais, porém, fundamentais para a identificação de potenciais neoantígenos. Foram utilizados dados de RNA-seq do projeto GEUVADIS e dados de mutações somáticas provenientes de melanoma do projeto TCGA para auxiliar na validação do pipeline desenvolvido. Como resultado, obteve-se a ferramenta, denominada neoANT-HILL, desenvolvida na linguagem de programação Python e, disponível através de uma interface gráfica amigável e interativa. A ferramenta utiliza dados provenientes do sequenciamento genômico ou exômico e/ou dados de RNA-Seq para a execução das análises imunogenômicas disponíveis. A integração dos resultados auxiliam na identificação precisa de potenciais neoantígenos candidatos à imunoterapia.
MEMBROS DA BANCA:
Interno - 2170415 - JORGE ESTEFANO SANTANA DE SOUZA
Presidente - 1939184 - SANDRO JOSE DE SOUZA
Externa à Instituição - ÂNDREA KELY CAMPOS RIBEIRO DOS SANTOS - UFPA