Desenvolvimento de pipelines para prospecção de peptídeos bioativos de origem vegetal com efeito antitrombótico
Mimetismo Molecular; Anticoagulante; Inibidor de Trombina; Peptídeos de plantas; Viridiplantae; Bioinformática.
As plantas oferecem um vasto potencial como fonte de substâncias ativas, possibilitando a incorporação de muitos extratos ou substâncias purificadas na prática da terapêutica moderna. O isolamento de peptídeos, pequenos polímeros de aminoácidos, com atividade biológica tem despertado o interesse pelas possíveis aplicações farmacêuticas ou nutracêuticas. Várias bases de dados e pipelines encontram-se disponíveis na literatura focados na organização de informações e descoberta de novos peptídeos. Métodos computacionais têm sido desenvolvidos para acelerar e facilitar o processo de descoberta de potenciais candidatos. As doenças cardiovasculares são a primeira causa de morte no mundo e o tratamento envolve, muitas vezes, o uso de fármacos antitrombóticos. O desenvolvimento de novos antitrombóticos é necessário para enfrentar as limitações das terapias disponíveis e fornecer aos pacientes tratamentos mais eficazes. Dessa forma, esse projeto visa desenvolver um pipeline para prospecção de novos peptídeos bioativos de origem vegetal e avaliar peptídeos candidatos à atividade antitrombótica, baseando-se nos mecanismos de ação de peptídeos conhecidos. O pipeline está sendo desenvolvido em código Python, compartilhado no GitHub e integra informações da base de dados de domínios estruturais CATH, uma etapa essencial para busca de peptídeos com possível mimetismo molecular. Como parte da metodologia, foi realizado um estudo de caso utilizando um peptídeo antitrombótico de amendoim de 6 aminoácidos. Como resultados dos testes foram identificados 25 novos candidatos a apresentarem atividade anticoagulante. Esses peptídeos foram ranqueados com base na comparação com a sequência de amendoim utilizando pontuações da matriz de similaridade BLOSUM62. Entre as perspectivas futuras, esperamos realizar a análise dos peptídeos encontrados frente a interação com os alvos biológicos. Além disso, pretende-se continuar o desenvolvimento da pipeline para obter uma ferramenta de fácil configuração e utilização para busca de novos peptídeos bioativos vegetais.