Análise baseada em biologia de sistemas destaca processos alterados que afetam a sobrevida geral de pacientes com sarcoma de Ewing
Sarcoma de Ewing, Autofagia, Resposta ao dano de DNA, Resposta imune, via do Hippo.
O Sarcoma de Ewing (SE) é uma doença altamente agressiva, sendo a segunda neoplasia óssea pediátrica mais frequente. A marca registrada do SE é a presença do fator de transcrição aberrante EWSR1-FLI que impulsiona a reprogramação metabólica no SE. A taxa de sobrevida dos pacientes de SE aumentou à custa da alta toxicidade que limita as taxas de sobrevida e causa morbidade significativa. Portanto, é crucial identificar e obter uma compreensão completa das vias que afetam a sobrevivência dos pacientes para o desenvolvimento de novos diagnósticos e estratégias terapêuticas. Aqui, identificamos diferenças no nível de expressão entre os sobreviventes de curto prazo e os de longo prazo com base em dados transcricionais disponíveis em três conjuntos de dados públicos, aplicando a análise do transcriptograma. Três grupos de genes diferencialmente expressos comuns às três coortes analisadas foram identificados. Processos relacionados à resposta e reparo ao dano do DNA, resposta imune, apoptose e autofagia foram desregulados entre os grupos com sobrevida curta e sobrevida longa. Além disso, o enriquecimento funcional dos genes comuns entre cada um dos três clusters e pelo menos um regulon de reguladores mestres específicos de SE, destacam a alta expressão da via Hippo em pacientes com sobrevida curta. Nossa análise sugere que diferentes processos podem estar orientando o desfecho de pacientes com SE de forma integrada e podem contribuir para a diversidade de fenótipos impulsionados pela flutuação da expressão de EWSR1- FLI1.