Análise de dados de metilação de DNA e de expressão gênica identifica potenciais biomarcadores para Medulloblastomas não-WNT
Câncer pediátrico, Biologia de Sistemas, Fator de Transcrição, Medulloblastoma, Regulon.
O meduloblastoma (MB) é um tipo de câncer pediátrico que afeta o cerebelo. Atualmente, há um consenso de que o MB pode ser classificado em quatro subgrupos distintos: WNT, SHH, grupo 3 e grupo 4. Neste trabalho, nós inferimos a rede regulatória e identificamos um conjunto de reguladores mestres (RMs) a partir de dados de expressão de cada um dos subgrupos examinados. O subgrupo WNT não foi investigado, tendo em vista que ele representa uma pequena porção de todos os casos do meduloblastoma, e seus pacientes apresentam uma taxa de sobrevida em cinco anos próxima a 100%. Um conjunto de regulons diferencialmente metilados (DM) também foi definido para cada subgrupo. Depois disso, os regulons identificados simultaneamente como RMs e regulons DM, para todos os subgrupos investigados, foram selecionados e nomeados "regulons de interesse". O teste hipergeométrico foi aplicado com o intuito de verificar se este grupo de regulons, obtido a partir da interseção dos seis conjuntos gerados anteriormente, é estatisticamente significativo. Como resultado, este teste retornou um p-valor de 7.558e-24. A influência dos regulons de interesse em outros tumores foi discutida, juntamente com os trabalhos futuros necessários para que haja uma melhor compreensão do papel desses regulons no desenvolvimento