Banca de QUALIFICAÇÃO: MARIA EDUARDA DE SOUZA MENEZES DA COSTA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : MARIA EDUARDA DE SOUZA MENEZES DA COSTA
DATA : 06/04/2018
HORA: 08:00
LOCAL: LAPLIC
TÍTULO:

SELEÇÃO DE MARCADORES GENÉTICOS E DESENVOLVIMENTO DE SISTEMAS PARA CLASSIFICAÇÃO DE VARIANTES DE PARASITAS DOS GÊNEROS TOXOPLASMA E CRYPTOSPORIDIUM

PALAVRAS-CHAVES:

Identificação molecular, GWAS, SNPs, Protozoários

PÁGINAS: 1
RESUMO:

O filo Apicomplexa engloba milhares de espécies, dentre elas, protozoários de importância médica. As espécies Toxoplasma gondii e Cryptosporidium spp. ganham destaque por infectarem milhões de pessoas no mundo. Por isso, a identificação e genotipagem desses parasitos é fundamental e pode permitir a correlação com as características de virulência do parasito.  O desenvolvimento de estratégias computacionais em bioinformática é fundamental para genotipagem e tipagem de parasitas, uma vez que as técnicas tradicionais muitas vezes não são viáveis e dependem de infra estrutura e reagentes laboriosos. Dados desse tipo contribuem ainda para estudos epidemiológicos, traçando origens de surtos, para o controle de dispersão de patógenos, entre outros fins.  Na primeira etapa desse trabalho, foram selecionados fatores de virulência de T. gondii e suas sequências foram obtidas do banco de dados do ToxoDB. As sequências das cepas que não estavam anotadas no ToxoDB, foram obtidas através do BLAST, utilizando a sequência da cepa ME49 como query. Posteriormente, as sequências de cada gene foram alinhadas usando o algoritmo do mafft. Com o resultado do alinhamento, foi feita uma análise de componente principal (PCA), para agrupar as sequências similares. Contudo, dada a complexidade do nosso conjunto de dados, até o momento não conseguimos identificar marcadores que possibilitem a tipagem dos protozoários em estudo. 

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1880243 - DANIEL CARLOS FERREIRA LANZA
Interno - 1513597 - JOAO PAULO MATOS SANTOS LIMA
Interno - 1507794 - RODRIGO JULIANI SIQUEIRA DALMOLIN