ANÁLISE BIOQUÍMICA QUÂNTICA DO REGULADOR TTGR E SEUS EFETORES: UMA PERSPECTIVA PARA O DESENVOLVIMENTO DE NOVAS DROGAS FRENTE AO MECANISMO DE RESISTÊNCIA MDR
MDR, bombas de efluxo, TtgR, efetores, quercetina, tetraciclina, cloranfenicol, Modelagem Molecular, DFT, MFCC
A problemática da resistência bacteriana MDR tem se tornado um acontecimento rotineiro na medicina atual, implicando em falha terapêutica. As bombas de efluxo colaboram de forma considerável para essa resistência aos agentes antibacterianos. O mecanismo de resistência MDR, presente em uma variedade de microrganismo, é controlado por reguladores transcricionais. TtgR é um repressor de ligação multidrogas da bomba de efluxo TtgABC, presente em P. putida. Ele apresenta uma forte similaridade com QacR, uma proteína de ligação de múltiplos fármacos de S. aureus. Expomos aqui três estruturas cristalográficas de TtgR, estirpe DOT-T1E, em complexo com o flavonoide quercetina e com os antibióticos tetraciclina e cloranfenicol. Através de dados cristalográficos e simulações computacionais foi possível analisar as interações energéticas desses ligantes ao sítio de ligação geral de TtgR utilizando a Teoria Funcional da Densidade (DFT) e do Método de Fracionamento Molecular com Capas Conjugadas (MFCC). Os resultados mostraram os valores energéticos de cada resíduo de aminoácido constituinte do sítio de ligação com os ligantes em análise. Essa avaliação se deu em um raio de até 13,0 Å de distância dos fármacos. Os resultados alcançados mostraram que esses ligantes se ligam ao sítio de ligação geral de forma semelhante, compartilhando resíduos de natureza hidrofóbica, como: LEU93, LEU92, ILE141, VAL171 e VAL96. Foi constatado algumas interações específicas com aminoácidos polares, como ARG176, que se fez importante para os complexos TtgR-QUE e TtgR-TAC e a HIS70 para os complexos TtgR-TAC e TtgR-CLM. Essa caracterização energética nos fornecem informações relevantes para compreensão da resistência MDR, concomitante a novas possibilidades no planejamento de drogas frente a esse mecanismo de resistência.