Banca de QUALIFICAÇÃO: RENATA LILIAN DANTAS CAVALCANTE

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : RENATA LILIAN DANTAS CAVALCANTE
DATA : 31/03/2022
HORA: 08:30
LOCAL: Google Meet
TÍTULO:

Prospecção de Genes com Potencial Biotecnológico para Piscicultura na Região Amazônica

PALAVRAS-CHAVES:

Peixes Amazônicos; Genômica; Filogenômica;

PÁGINAS: 36
RESUMO:

A bacia amazônica, com sua grandiosa biodiversidade, abriga cerca de 15% das espécies de peixes de água doce do mundo. Devido às condições ambientais desta área, a exploração pesqueira está entre as principais atividades socioeconômicas da região. Entre as espécies de interesse econômico estão dois gigantes endêmicos dos rios da região: Brachyplatystoma filamentosum (ordem: Siluriforme) conhecido como Piraíba ou Filhote, e Arapaima gigas (ordem: Osteoglossiformes) conhecido como Pirarucu. Seu tamanho único atrai grande interesse econômico para o desenvolvimento da região, mas estudos no contexto molecular relativos a estas características de interesse, como o gigantismo e o mecanismo de diferenciação sexual, ainda são pouco conhecidos. Contudo, com a disponibilidade de dados genômicos e transcriptômicos de algumas espécies do mesmo grupo taxonômico depositados em repositórios públicos de dados biológicos como o NCBI, permite estudos que visam encontrar regiões genômicas associadas que sejam de interesse para o melhoramento de seu manejo, produção e conservação. Este trabalho, propõe-se minerar dados presentes em vários bancos de dados públicos, utilizando uma metodologia com abordagens de genômica e filogenômica, a fim de identificar genes com potencial biotecnológico, relacionados tanto com melhorias na produção pesqueira como na preservação e manejo consciente das espécies de peixes em questão. Para isso, estamos elaborando 3 diferentes estratégias de investigação usando os dados de peixes depositados em bancos públicos. I) Melhorar os assemblies de A. gigas montando um assembly hibrido com a união de dados genômicos publicados por diferentes grupos de estudo; II) Procurar potenciais regiões genômicas ligadas ao sexo através da identificação de regiões genômicas haplotípicas específicas em Scleropages formosus, que é uma espécie próxima de A. gigas. E por fim, III) analisar os dados de DNA mitocondrial de 137 Siluriformes depositados no NCBI, mais o mtDNA do Filhote e 10 outgroups para realizar uma análise filogenética com o auxílio da ferramenta BEAST. Para a montagem dos assemblies de A. gigas obtivemos a geração de 3.975 scaffolds para reads unicamente de fêmeas, 1.473 scaffolds para machos e 2.258 scaffolds para todas as reads, que se monstraram um menor número de scaffolds quando comparado a montagens anteriores. O tamanho total das novas montagens foi de 667 Mb, 677 Mb e 692 Mb para fêmeas, machos e todas as reads, respectivamente, o que resultou em uma maior diferença entre as montagens sexo especifica em comparação com trabalhos anteriores. Já na análise das regiões haplótipos-específicas de Scleropages formosus, encontramos genes que poderiam estar envolvidos no processo biológico relacionado com o mecanismo de determinação do sexo, tais como o grupo Homeobox (embriogênese), SPDYA (ciclo celular meiótico na linha germinativa masculina) e fator nuclear semelhante a ovário 7 (presente na fase embrionária e adulta de Zebrafish), todos localizados no cromossomo 1 de Arowana. Este estudo, há de ampliar o conhecimento da genética dos peixes endêmicos da bacia amazônica, além de trazer um ganho em conhecimento científico, com a identificação de genes relacionados ao gigantismo entre os peixes da ordem Siluriformes e do gênero Arapaima. O que pode viabilizar o melhoramento comercial destes organismos a partir dessa característica morfológica oriunda da própria da espécie.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 3063244 - TETSU SAKAMOTO
Interno - 2170415 - Jorge Estefano de Santana Souza
Externo à Instituição - SIDNEY EMANUEL BATISTA DOS SANTOS - UFPA