Banca de QUALIFICAÇÃO: PRISCILA CAROLINE DE SOUSA COSTA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : PRISCILA CAROLINE DE SOUSA COSTA
DATA : 21/12/2021
HORA: 20:00
LOCAL: https://meet.google.com/pei-ebdz-mqq
TÍTULO:

Anotação notação funcional de domínios de função desconhecida (DUF) auxiliado por dados de predição in silico da sua estrutura tridimensional

PALAVRAS-CHAVES:

DUF, domínios de proteína, AlphaFold, similaridade estrutural de proteínas, FATCAT

PÁGINAS: 36
RESUMO:

Os estudos da proteômica tem mostrado o grande número de proteínas descobertas e a sua importância para o estudo da vida. Porém, ainda existe uma alta porcentagem dessas proteínas que não foram anotadas funcionalmente e que para os avanços da saúde e biotecnológico essa definição de proteínas desconhecidas é essencial. As funções das proteínas são definidas pela sua conformidade e mudança da estrutura tridimensional da proteína, por isso, dados da estrutura tridimensional dessas proteínas auxiliam na definição de suas funções. Atualmente, existe uma grande quantidade e diversidade de proteínas que possuem sua sequência caracterizada, porém ainda há um gargalo metodológico para a obtenção de seus dados estruturais. Com o recente desenvolvimento do programa AlphaFold, que prediz de forma acurada a estrutura tridimensional de proteínas a partir de sua sequência de aminoácidos, este gargalo pode ser superado. Assim, o objetivo desse projeto é avaliar o impacto do uso dessas ferramentas de predição estrutural nas anotações funcionais de proteínas. Neste trabalho, procuramos anotar funcionalmente domínios proteicos de função desconhecida (DUF). Para isso, dados preditos da sua estrutura tridimensional foram submetidos a ferramentas computacionais que realizam uma busca por outras estruturas que compartilhem similaridade estrutural. Análises preliminares demonstraram que muitos domínios podem ser beneficiados com esta análise. Além disso, geramos um modelo de classificação que identifica se duas proteínas que compartilham uma similaridade estrutural são homólogas remotas. Este classificador será utilizado futuramente para analisar os resultados de similaridade e sugerir funções a esses domínios.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 3063244 - TETSU SAKAMOTO
Interno - 059.501.268-07 - JOSÉ MIGUEL ORTEGA - UFMG
Interno - 3083298 - RENAN CIPRIANO MOIOLI