Banca de DEFESA: TAYNÁ DA SILVA FIÚZA

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : TAYNÁ DA SILVA FIÚZA
DATA : 04/12/2019
HORA: 14:00
LOCAL: Sala de aula BioME
TÍTULO:

Investigação in silico de epítopos oriundos de linhagens de Mycobacterium avium subsp. hominissuis como candidatos vacinais

PALAVRAS-CHAVES:

Vacinologia Reversa, Surfaceoma, Mycobacterium avium.

PÁGINAS: 52
RESUMO:

Micobactérias não tuberculosas são micobactérias ambientais responsáveis por um crescente número de infecções respiratórias e sistêmicas nas últimas décadas, especialmente entre crianças, idosos e indivíduos imunodeficientes. O complexo do Mycobacterium avium, composto por M. avium e M. intracellulare é responsável pela maior parte desses casos e esta primeira espécie possui quatro subespécies de diferentes capacidades infecciosas e hospedeiros. Uma dessas subespécies, Mycobacterium avium subsp. hominissuis, foi isolada de humanos e suínos, enquanto outras variedades infectam gado, aves e animais silvestres. Até o presente momento o tratamento das infecções causadas pelo complexo se dá pelo uso de múltiplos antibióticos em um regime longo, custoso e por vezes ineficiente. A identificação de alvos efetivos para o controle desses organismos é essencial e desafiadora uma vez que proteínas de superfície, as quais são moléculas alvo chave em diversas imunoterapias bem-sucedidas, são de difícil isolamento. Além disso, o desenho de imunoterapias e formulações vacinais dependem da identificação de peptídeos de maior interesse imunológico os quais decorrem de protocolos repetitivos e custosos. Nesse trabalho buscou-se integrar ferramentas computacionais de maneira a investigar proteínas de superfície com porções imunogênicas expostas e ubíquas a linhagens de Mycobacterium avium subsp. hominissuis. Para isto, 32648 proteínas de 7 diferentes linhagens de Mycobacterium avium subsp. hominissuis, obtidas do NCBI, foram submetidas à predição de seus domínios trans-membranares pelo software TMHMM e as 3426 sequências contendo estes domínios foram agrupadas em 577 clusters com respeito a sua homologia de modo a classificar proteínas de membrana comuns a todas esses organismos utilizando ferramentas da plataforma CMG Biotools. Utilizando essas sequências, juntamente com os métodos disponíveis no IEDB foram empregados em predições de afinidade aos 27 alelos de MHC mais frequentes em diversas populações humanas e os peptídeos de maior imunogenicidade foram selecionados, restando 113 clusters. Dos peptídeos altamente imunogênicos presentes, apenas os pertencentes a 59 clusters cujas sequências os situavam mais de 50% na porção externa da membrana foram considerados possíveis candidatos a uma formulação vacinal. Foram ainda calculadas a conservação dos peptídeos (presença nas diferentes linhagens analisadas), em que 60% dos clusters são completamente formados por peptídeos ubíquos e a promiscuidade dos mesmos (número de diferentes MHCs aos quais se ligam), em que apenas um cluster possui um peptídeo com alta afinidade a quatro MHCs distintos. Com respeito aos candidatos para a formulação vacinal, um conjunto mínimo de 9 peptídeos com alta afinidade ao número maior de MHCs distintos foi selecionado com peptídeos interagindo com 15 moléculas. Nenhuma das sequências desses peptídeos candidatos mostrou potencial para geração de reatividade cruzada com proteínas humanas ou suínas. O trabalho computacional aqui desenvolvido poderá ser aplicado a outros conjuntos de organismos de maneira a identificar possíveis candidatos para aplicações vacinais.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1267860 - GUSTAVO ANTONIO DE SOUZA
Interno - 3063244 - TETSU SAKAMOTO
Externo à Instituição - HELENA PAULA BRENTANI