Análise transcricional da diferenciação neuronal durante o desenvolvimento do córtex cerebral e reprogramação celular
RNAseq de célula única; progenitores neurais; neurônios; reprogramação celular; neurônios induzidos.
O desenvolvimento do córtex cerebral em mamíferos é um evento complexo e altamente orquestrado. Ao longo do período embrionário, progenitores originam uma enorme diversidade de neurônios, com diferentes fenótipos moleculares. No entanto, ainda permanece em intenso debate de que maneira progenitores comuns ou múltiplos originariam a enorme diversidade neuronal encontrada no córtex cerebral adulto. Nos últimos anos, diversos grupos de pesquisa realizaram o sequenciamento de RNA mensageiro de progenitores e neurônios individuais ao longo do desenvolvimento do córtex cerebral in vivo e em modelos in vitro utilizando células-tronco neurais ou reprogramação de células somáticas em neurônios induzidos (iNs). Neste trabalho, utilizamos ferramentas de bioinformática, tais como as técnicas de aprendizado de máquina, para analisar o transcriptoma de células progenitoras, neurônios primários e iNs, com a finalidade de identificarmos assinaturas transcricionais associadas com a diferenciação de fenótipos neuronais específicos. Com isso, buscamos avaliar a possível existência de subtipos de progenitores para diferentes classes de neurônios durante o desenvolvimento do córtex cerebral, assim como identificar genes candidatos para a reprogramação de células somáticas em iNs com fenótipos definidos.