O papel central da proteína CDC48: uma rede baseada na resposta ao estresse oxidativo em Saccharum spp.
Saccharum spp. Peróxido de hidrogênio. Estresse oxidativo. Resposta ao estresse. Biologia de sistemas.
O estresse oxidativo em plantas envolve uma série de mecanismos de sinalização derivados de uma organização em rede, e o acúmulo da molécula de H2O2 em níveis elevados podem causar efeitos metabólicos que podem comprometer o desenvolvimento da planta. Neste estudo a partir de 6 proteínas associadas a resposta do estresse por H2O2 obtidas via análise proteômica por sequenciamento direto, utilizamos recursos da bioinformática e ferramentas em biologia de sistemas para identificar vias de sinalização associadas à resposta mediante tratamento exógeno com H2O2 em raízes de Saccharum spp. Por meio da construção de uma rede de interação proteína -proteína e sua análise de ontologia e topologias de rede foi possível identificar vias associadas aos açúcares, revelando TREALOSE-6-FOSFATO (T6P) como um sinalizador específico para sacarose e regulador da utilização de tal açúcar na planta. Além disso, tomando como pressuposto a centralidade das proteínas constituintes da rede, ident ificamos a proteína CDC48 como o único ponto central que possui múltipla interface de ligação com as outras proteínas da rede, formando complexos proteicos e módulos que podem estar associados a Degradação da Proteína Associada ao Retículo Endoplasmático (ERAD) que atuam reduzindo o estresse causado pelo acúmulo de H 2O2 no Retículo Endoplasmático (RE), removendo assim para o proteassoma proteínas unfolfed/misfolded que poderiam prejudicar o desenvolvimento da planta. Estas respostas regulatórias além de c ontribuir para aclimatação da planta no ambiente, fornece subsídios para a compreensão das possíveis interações entre os sistemas da resposta oxidativa em cana -de-açúcar.