Banca de QUALIFICAÇÃO: LUCAS FELIPE DA SILVA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : LUCAS FELIPE DA SILVA
DATA : 30/03/2021
HORA: 14:00
LOCAL: remoto plataforma google meet
TÍTULO:

ABORDAGENS DE BIOINFORMÁTICA APLICADAS NA ANÁLISE DOS DADOS GERADOS POR ESTRESSE ABIÓTICO: MICROGRAVIDADE E POR PERÓXIDO DE HIDROGÊNIO EM PLANTAS DE CANA-DE-AÇÚCAR

PALAVRAS-CHAVES:

Foguete de sondagem VSB-30, microgravidade, RNA-seq, estresse oxidativo, transcriptoma, enriquecimento, Saccharum spp.

PÁGINAS: 63
RESUMO:

A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) é uma monocotiledônea da família Poaceae, uma planta C4, com alta taxa fotossintética e adaptada a regiões de clima tropical e subtropical e com alto nível de poliploidia resultante do cruzamento interespecífico. O Brasil é seu maior produtor mundial. De natureza séssil, as plantas estão expostas a diferentes fatores bióticos e abióticos que podem promover uma condição de estresse oxidativo. No entanto, se os níveis de EROs se sobrepor aos mecanismos antioxidantes para manter a homeostase, então podem causar diversos danos ao seu desenvolvimento. Alteração nesse campo gravitacional pode desencadear respostas nas plantas semelhantes às respostas dos estresses abióticos. No presente trabalho foi analisado os dados de sequenciamento de RNA de plantas de cana-de-açúcar submetidas ao voo do foguete de sondagem VSB-30. Este material foi submetido a seis minutos de microgravidade. Assim, utilizando abordagens de bioinformática, este trabalho teve como intuito de identificar genes que apresentaram expressão diferencial sob a condição da microgravidade em raízes e folhas nas orientações horizontal e vertical. Para isto, foi adotado a espécie Sorghum bicolor, como genoma referência para a realização do alinhamento e as espécies Zea mays, Oryza sativa e outras gramíneas na descrição por homologia dos genes identificados e não caracterizados. Os resultados desta análise de bioinformática mostraram quais foram os genes únicos e específicos para cada uma das nove bibliotecas de dados analisadas como por exemplo os genes C5YT78, C5YWA7 e C5WLY2. Foi identificado também quais foram as vias metabólicas enriquecidas em resposta à condição da microgravidade como: Phosphatidylinositol signaling system e Amino sugar and nucleotide sugar metabolism. Assim, os resultados obtidos com abordagens de bioinformática possibilitam uma melhor compreensão de resultados obtidos anteriormente como a perda organização estrutural dos tecidos após a recuperação deste material, além do acúmulo de lignina, H₂O₂ e EROs. Desta forma estes resultados da histologia, bioquímica e analise do RNAseq permitiram, verificar que a alteração da gravidade foi percebida pela planta de cana-de-açúcar e traduzida sinalização por meio das espécies reativas de oxigênio em condições de estresse e correlacionou as diversas vias metabólicas enriquecidas como a via da Pentose phosphate pathway e o RNA transport a cada resposta, buscando esclarecer quais genes estão envolvidos, como ocorre o processo de sinalização e como a via metabólica são ativada nas folhas e raízes horizontal e vertical submetidas a microgravidade. Portanto, o presente trabalho auxiliou na identificação dos genes, das vias metabólicas ativas e compreensão das diversas respostas da planta de cana-de-açúcar sob a condição da alteração do padrão de gravidade com o voo do foguete de sondagem VSB-30.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1453487 - KATIA CASTANHO SCORTECCI
Interno - 1513597 - JOAO PAULO MATOS SANTOS LIMA
Externo à Instituição - CARLOS HENRIQUE SALVINO GADELHA MENESES - UEPB