Banca de QUALIFICAÇÃO: DANILO LOPES MARTINS

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : DANILO LOPES MARTINS
DATA : 19/11/2019
HORA: 08:30
LOCAL: BioME - PPg-Bioinfo
TÍTULO:

Análise exploratória do transcriptoma do Arapaima gigas

PALAVRAS-CHAVES:

Transcriptoma; Sequenciamento de nova geração; Expressão gênica; Genes candidatos.

PÁGINAS: 27
RESUMO:

O Arapaima gigas, conhecido como pirarucu, é considerado um dos maiores peixes de água doce do mundo, com um crescente interesse no mercado da aquicultura devido às suas características biológicas particulares, incluindo o seu rápido crescimento nos seus primeiros anos de vida. Nos últimos anos, apesar da disponibilização massiva de dados advindos de projetos de sequenciamento, poucos foram os que abordaram o táxon que inclui essa espécie. Através do sequenciamento do cDNA de 12 amostras de tecidos diferentes do Arapaima gigas, montamos um transcriptoma de referência que combina as estratégias de montagem de novo e guiada pelo genoma referência. Foi analisada a expressão gênica de gênero entre diferentes tecidos masculinos e femininos de espécimes adultos. Utilizamos pipelines como Hisat2, Braker2, Trinity, Diamond e mygene para a montagem e anotação dos genes. O presente estudo foi desenvolvido com a finalidade de disponibilizar um transcriptoma final, categorizar através de uma  análise exploratória transcricional as expressões gênicas específicas de processos relacionados a sexagem, gigantismo, além de evidenciar genes de tecidos específicos, genes ainda não identificados e isoformas ancestrais de genes. Neste estudo evidenciamos a descoberta de genes ainda não descritos em repositórios públicos assim como um conjunto de produtos gênicos anotados que podem ser candidatos a afetar o dimorfismo sexual no pirarucu, seu tamanho e desenvolvimento acelerado e ainda como genes candidatos relacionados a ancestralidade explicam suas características morfológicas únicas.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 2170415 - JORGE ESTEFANO SANTANA DE SOUZA
Interno - 3063244 - TETSU SAKAMOTO