Banca de DEFESA: PAULO EDUARDO TOSCANO SOARES

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : PAULO EDUARDO TOSCANO SOARES
DATA : 11/03/2019
HORA: 14:00
LOCAL: BioME - PPg-Bioinfo
TÍTULO:

Metagenoma de um camarão Penaeus vannamei infectado com o vírus causador da Síndrome da Mancha Branca


PALAVRAS-CHAVES:

Camarão da pata branca, microbiota, metagenômica shotgun, WSSV


PÁGINAS: 46
RESUMO:

O camarão de patas brancas (Penaeus vannamei) é a espécie mais cultivada na
aquicultura mundial. O cultivo comercial geralmente ocorre em densidades altas o que
propicia a seleção de patógenos virulentos, causando surtos epidêmicos. Dentre os
patógenos que acometem a carcinicultura, o vírus causador da Síndrome da Mancha
Branca (White Spot Syndrome Virus - WSSV) é conhecido por surtos que podem
resultar em mais de 80% de mortalidade em menos de uma semana. Em decorrência
disso, o uso de estratégias preventivas que possibilitem a identificação e
acompanhamento da microbiota nos cultivos tem se tornado cada vez mais necessária,
sobretudo em sistemas intensivos. Recentemente, o uso da metagenômica foi sugerido
para o monitoramento em aquicultura. Vários estudos usaram metagenômica 16S, para
estudar a microbiota associada a camarões saudáveis ou infectados com patógenos
específicos. Outros estudos abordaram a metagenômica shotgun para descobrir novos
vírus. A metagenômica shotgun é potencialmente mais informativa que a metagenômica
por genes marcadores, permitindo a recuperação de informação genômica do hospedeiro
e seus simbiontes, incluindo vírus, cuja composição pode atuar como bioindicadores do
estágio da doença. Neste estudo, a metagenômica shotgun foi utilizada para analisar o
músculo caudal de um exemplar de P. vannamei infectado pelo WSSV. Classificações
taxonômicas e funcionais foram feitas para se obter os respectivos perfis dos dados
metagenômicos. P. vannamei e WSSV foram os organismos mais abundantes na
classificação por reads. Na análise dos contigs, foi observada maior abundância de
contigs para camarão, bactérias e WSSV respectivamente. A classificação funcional foi
realizada por meio do software MEGAN e resultou em poucos grupos representativos
de funções proteicas, que não foram suficientes para estabelecer um perfil funcional da
amostra. Uma classificação taxonômica a partir do BLASTx também foi realizada com
o MEGAN e apresentou resultados similares a classificação usando BLASTn. Os
resultados do BLASTn possibilitaram a montagem do genoma mitocondrial completo
do P. vannamei. Este estudo fornece suporte para o uso da metagenômica shotgun
como uma ferramenta para o monitoramento da microbiota em cultivos de camarão,
sendo possível recuperar simultaneamente informações úteis para a genética de
populações (através do o genoma mitocondrial do camarão) e o monitoramento de
simbiontes e patógenos, como as bactérias e o WSSV.

 


MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1880243 - DANIEL CARLOS FERREIRA LANZA
Interno - 2170415 - JORGE ESTEFANO SANTANA DE SOUZA
Externo à Instituição - ANDRE MAURICIO RIBEIRO DOS SANTOS
Notícia cadastrada em: 01/03/2019 16:56
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