Banca de QUALIFICAÇÃO: ANA CAROLINA MIRANDA FERNANDES COÊLHO

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : ANA CAROLINA MIRANDA FERNANDES COÊLHO
DATA : 06/12/2018
HORA: 11:20
LOCAL: IMD - Sala B206
TÍTULO:

neoANT-HILL: ferramenta integrada para a detecção de potenciais neoantígenos


PALAVRAS-CHAVES:

Neoantígenos;. Câncer. Análises Imunogenômicas.


PÁGINAS: 41
RESUMO:

Os neoantígenos têm gerado grande interesse na imunoterapia devido à sua capacidade de elicitar respostas imunológicas antitumorais. Os neoantígenos surgem como consequências de mutações especificas do tumor e podem ser reconhecidos pelas células T do sistema imunológico. Estudos pré-clínicos em humanos indicaram resultados promissores quanto ao uso dos neoantígenos para o desenvolvimento de vacinas imunoterapêuticas. O objetivo do presente trabalho foi desenvolver uma ferramenta computacional que integre análises imunogenômicas fundamentais para a identificação e classificação dos neoantígenos. A ferramenta, denominada neoANT-HILL, foi desenvolvida na linguagem de programação Python com uma interface gráfica amigável e interativa. A ferramenta neoANT-HILL é flexível quanto ao dado de entrada aceitando dados genômicos e/ou de RNA-Seq. A partir desses dados, neoANT-HILL é capaz de identificar mutações somáticas tumor-específicas, traduzir as sequências proteicas alteradas correspondentes, realizar a tipagem in silico dos alelos de HLA da classe I, estimar a abundância dos transcritos alterados no tumor, caracterizar o perfil imunológico tumoral e estimar a afinidade de ligação entre os alelos de HLA e os peptídeos alterados. A associação dos resultados de todas essas análises imunogenômicas auxiliam na identificação e na classificação dos potenciais neoantígenos candidatos à imunoterapia.


MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1939184 - SANDRO JOSE DE SOUZA
Interno - 1513597 - JOAO PAULO MATOS SANTOS LIMA
Notícia cadastrada em: 30/11/2018 16:02
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