Banca de QUALIFICAÇÃO: UASKA BEZERRA E SILVA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: UASKA BEZERRA E SILVA
DATA: 22/03/2013
HORA: 13:00
LOCAL: Sala SS1 do Centro de Biociências da UFRN
TÍTULO:

PROSPECÇÃO DE NOVOS GENES QUE CONFIRAM RESISTÊNCIA AO ESTRESSE SALINO.


PALAVRAS-CHAVES:

Estresse salino, osmólito e metagenoma.


PÁGINAS: 60
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Genética
RESUMO:

A busca por genes baseado na construção e análise de bibliotecas metagenômicas a partir de solo gera oportunidades para explorar uma enorme diversidade genética  e metabólica de microrganismos. Os rios são ecossistemas com alta diversidade  biológica mais pouco explorado por meio de metagenomas. Com esse objetivo, uma biblioteca metagenômica foi construída a partir de DNA extraído de substrato do rio em três pontos ao longo do rio Jundiaí-Rio Grande do Norte. Os pontos de amostragem são derivados de área aberta, terreno acidentado e com a incidência direta da luz solar. O solo é úmido, compacto, de cor escura e coberto com finas camadas de sal. O rio é caracterizado por drenagem intermitente e alta salinidade, que pode ser superior a quatro vezes a concentração do mar. Esta biblioteca foi analisada funcionalmente e também com base em sequências. Para a análise funcional, foi utilizado meio de  cultura sólido de Luria-Bertani (LB) com a concentração de NaCl variando de 0,17M a 0,85M. Foram obtidos 15 clones positivos com características halotolerantes. Os DNAs recombinantes foram extraídos e retransformados em DH10B e curvas de sobrevivência foram obtidas para confirmação e quantificação da resistência ao estresse abiótico. As sequências dos clones foram obtidas e submetidas a ferramenta BLASTX e assim foi comprovado que alguns clones codificavam proteínas hipotéticas. Um dos clones apresentou uma  ORF completa com elevada similaridade de glucose-6-fosfato-isomerase que participa na síntese do percurso de glicerol e serve como um soluto compatível para equilibrar a pressão osmótica no interior e no exterior das células. Posteriormente, com o intuito  de identificar genes que codificam osmolitos relacionados com a halotolerância, amostras de DNA ambiental do substrato do rio e da coluna d´água do estuário e oceano foram piro sequenciadas.sequências de osmolitos de diferentes microrganismos foram obtidas a partir do UniProt e usado como RefSeqs para a identificação por homologia (TBLASTN) nos bancos de dados. As sequências foram submetidas a HMMER para a identificação de domínios funcionais e sequências não redundantes para evitar a quantificação repeti da de um mesmo microrganismo e permitir o agrupamento dos dados por metagenoma. Foram identificados trealose, ectoine, sorbitol, glicerol, inositol-3-fosfato desidrogenase, chaperone, a betaína de glicina e prolina oxiredutase. Estes são osmólitos comumente relacionados a ambientes salinos, no entanto, é aceitável que microrganismos presentes no rio possam produzir esses solutos devido a alta concentração de sal no solo e na água durante a estação de seca neste rio. Isso confirma a existência de uma resposta especializada contra o estresse salino por bactérias no ambiente do rio Jundiaí.


MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1674709 - VIVIANE SOUZA DO AMARAL
Externo ao Programa - 1549705 - ADRIANA FERREIRA UCHOA
Externo ao Programa - 1544647 - MATHEUS DE FREITAS FERNANDES PEDROSA
Notícia cadastrada em: 22/03/2013 12:39
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