Banca de DEFESA: JULIANA GABRIELA SILVA DE LIMA

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : JULIANA GABRIELA SILVA DE LIMA
DATA : 15/09/2021
HORA: 13:30
LOCAL: Videoconferência
TÍTULO:

SEQUÊNCIAS 2A E 2A-LIKE EM VÍRUS COM GENOMA DE RNA: OCORRÊNCIAS E IMPLICAÇÕES EVOLUTIVAS

PALAVRAS-CHAVES:

Sequências 2A/2A-like, Pseudo 2A-like, 2A-like ranking, família Totiviridae, Giardiavirus expandido, IMNV-like, GLV-like.

PÁGINAS: 91
RESUMO:

As sequências 2A/2A-like são oligopeptídeos que possuem aproximadamente 18-22 aminoácidos e podem mediar uma “clivagem” co-traducional de poliproteínas em células eucarióticas. Esses peptídeos são caracterizados por ter um motivo C-terminal de nove aminoácidos -(G/H)D(V/I)EXNPGP. Essas sequências são encontradas em muitos vírus com genomas de fita simples de RNA com polaridade positiva (pssRNA) ou dupla fita de RNA (dsRNA) que infectam diversos hospedeiros que variam desde espécies de protozoários até vertebrados. Devido à sua capacidade de clivagem, as sequências 2A/2A-like têm sido utilizadas em muitos sistemas de coexpressão heterólogos. Tendo em vista a importância das sequências 2A/2A-like, o presente trabalho teve como objetivo investigar e registrar a presença dessas sequências em diferentes espécies de vírus, e avaliar a importância evolutiva dessas sequências na família Totiviridae. O primeiro capítulo deste trabalho apresenta uma revisão da ocorrência das sequências 2A/2A-like em diferentes genomas virais por meio do alinhamento destas sequências com o banco de dados do NCBI utilizando a ferramnta Blastp. A abordagem utilizada possibilitou ainda a identificação de 69 novas notificações de sequências virais que contêm 2A-likes, dentre as quais estão 62 pssRNA vírus, 6 dsRNA vírus e em um vírus com genoma de fita simples de RNA com polaridade negativa (nssRNA). Tarata-se do primeiro relato de uma sequência desse tipo em um nssRNA vírus. No segundo capítulo, estão apresentadas as relações filogenéticas entre os vírus da família Totiviridae através de uma inferência bayesiana, a partir da qual foi possível sugerir a criação do grupo Giardiavirus expandido, que compreende os vírus anteriormente agrupados em Giardiavirus, Artivirus e oito novos vírus, os quais foram divididos entre os grupos IMNV-like e GLV-like e tiveram sua ORF1 caracterizada utilizando ferramentas de bioinformática. A partir desta caracterização foram encontradas sequências semelhantes a 2A-likes em alguns vírus do grupo GLV-like, as quais foram denominadas de pseudo 2A-likes. Para avaliar se essas sequências poderiam se tornar 2A-likes funcionais o software 2A-like ranking foi desenvolvido. As análises realizadas neste programa evidenciaram que os vírus do grupo GLV-like que infectam artrópodes tem aproximadamente 50 a 76% de chance de se tornarem 2A-likes funcionais. A presença de pseudo 2A-likes em outros vírus de dsRNA também foi verificada utilizando o banco de dados do NCBI onde foi possível encontrar 96 sequências que apresentavam pseudo 2A-likes. A familia totiviriade se apresentou como um bom modelo para o estudo da evolução das sequências 2A/2Alike, dada sua grande diversidade de espécies que infectam diferentes tipos de hospedeiros. Os resultados obtidos sugerem a existência de uma correlação entre a diversidade de hospedeiros e de estruturas dos genomas dos vírus da família Totiviridae, podendo esta ser explicada pelo surgimento de sequências 2A-like funcionais a partir de sequências ancestrais descritas aqui como pseudo 2A-like. Assim, os pseudo 2A-likes podem ser um ponto-chave na evolução viral, atuando como forma de incremento ou manutenção de complexidade do genoma.

MEMBROS DA BANCA:
Externo à Instituição - GUSTAVO COSTA BRESSAN - UFV
Externo à Instituição - ARTHUR GRUBER - USP
Presidente - 1880243 - DANIEL CARLOS FERREIRA LANZA
Externo ao Programa - 348473 - JOSE VERISSIMO FERNANDES
Externo ao Programa - 1715230 - JOSELIO MARIA GALVAO DE ARAUJO