Banca de QUALIFICAÇÃO: GÉSSICA LAIZE BERTO GOMES
Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.DISCENTE : GÉSSICA LAIZE BERTO GOMES
DATA : 24/04/2020
HORA: 09:00
LOCAL: videoconferencia
TÍTULO:
CARACTERIZAÇÃO DA INTERAÇÃO PROTEICA DA PROTEÍNA REPRESSORA À AUXINA (ARP) EM RESPOSTA AO CONTROLE DE FLORAÇÃO TOMATE
PALAVRAS-CHAVES:
Solanum lycopersicum, Auxin Repressed Protein, Transição Floral, Duplo híbrido, FITOENO SINTASE, CBS, Myf5, APE1 e GRX1.
PÁGINAS: 119
RESUMO:
A floração é um importante processo de transição da fase vegetativa para o desenvolvimento reprodutivo das plantas, um ponto crucial para o desenvolvimento da planta para garantir o sucesso reprodutivo. Dados anteriores do nosso grupo de pesquisa, utilizando biblioteca subtrativa, identificaram uma sequência com homologia a Auxin Repressed Protein (ARP). Essa proteína participa da via de sinalização de auxina e regula provavelmente diversos processos fisiológicos importantes plantas. Diante disso, objetivou-se com este trabalho compreender qual o papel da proteína ARP no tomate e no processo de transição floral. Primeiramente, utilizando ferramentas de bioinformática foi realizado um alinhamento múltiplo da sequência utilizando 13 sequencias homólogas no programa Clustal Omega. Este alinhamento, observou-se que a proteína ARP do tomate apresenta o domínio I rico em leucina, que tem repressão anfifílica no seu N-terminal. O domínio II que contém um núcleo interno com motivo composto de glicina, triptofano e prolina. Além disso, na região C-terminal, existem os domínios III e IV, que juntos formam o domínio PB1 (Phox/Bem1p). Este domínio contém lisina invariante típicas e uma série de resíduos ácidos. Utilizando o banco de dados STRING 10.0 (http://www.string-dg.org) com índice alto confidência 0.7, foi possível observar uma rede de interação em que a proteína ARP1 interage com mais 21 proteínas. Dentre estas, nós destacamos as proteínas CBS, Myf5, APE1 e GRX1, os quais interagem diretamente com a proteína ARP1. E estas são proteínas expressas nos tecidos reprodutivos do tomate como o, através da ferramenta eFPBar (http://bar.utoronto.ca/efp_tomato/cgi-bin/efpWeb.cgi). Além disso, por meio de ensaios de dois híbridos, foi observado in vivo 8 interações proteína-proteína. Três dessas sequências codificam para duas proteases putativas e a proteína CITOCROMO C-OXIDASE. Outras cinco sequências codificam para a proteína FITOENO SINTASE. Com o auxílio do programa Cytoscape 3.7.2 foi gerado uma rede interativa, utilizando tanto os dados in sílico e in vivo. Com isso, foi possível identificar a formação de cinco clusters, que provavelmente estão envolvidos na regulação de metabolismo energético da planta, mecanismo de crescimento e diferenciação celular. Estas vias podem estar atuando na transição floral do tomate. Considerando estes resultados obtidos com a proteína ARP1, será importante também identificar quais proteínas que estão superexpressas usando a ferramenta da proteômica em plantas transgênicas contendo o cassete de superexpressão, assim como medir o nível do hormônio auxina nestas no intuito de compreender melhor o papel da proteína ARP1.
MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1549705 - ADRIANA FERREIRA UCHOA
Interno - 1228866 - EDUARDO LUIZ VOIGT
Externo à Instituição - CARLOS HENRIQUE SALVINO GADELHA MENESES - UEPB