Banca de DEFESA: MÁRCIA DANIELLE DE ARAÚJO DANTAS

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : MÁRCIA DANIELLE DE ARAÚJO DANTAS
DATA : 15/03/2019
HORA: 14:00
LOCAL: Sala Carl Peter von Dietrich - Departamento de Bioquímica
TÍTULO:

Estudo dos Genomas dos Principais Vírus que Acometem a Carcinicultura no Brasil

PALAVRAS-CHAVES:

IMNV, WSSV, PstDNV, Filogenia, Camarão

PÁGINAS: 106
RESUMO:

A região Nordeste é uma das maiores produtoras de camarão no Brasil, com destaque para os estados do Rio Grande do Norte e Ceará. Um dos maiores problemas que a indústria da carcinicultura vem enfrentando nas últimas décadas é o aumento da incidência de doenças infecciosas, as quais causam grandes perdas econômicas para o setor. Dentre essas doenças destacam-se aquelas causadas pelo Vírus da Síndrome da Mancha Branca (WSSV), o Penaeus stylirostris densovirus (PstDNV) e o Vírus da Mionecrose Infecciosa (IMNV). O estudo dos genomas desses vírus é de fundamental importância para entender mecanismos essenciais à sobrevivência dos mesmos e, assim, desenvolver ferramentas eficazes para detecção e controle. Nesse contexto, o objetivo geral deste trabalho foi estudar os genomas dos vírus IMNV, WSSV e PstDNV e contribuir com novas informações sobre a biologia destes patógenos. O capítulo 1 descreve o estudo de sequências de membros da família Totiviridae. Os resultados mostram que o IMNV e outros vírus da família que infectam artrópodes apresentam características que os classificam em um novo grupo denominado preliminarmente como Artivirus. O alinhamento de aminoácidos da ORF1 indica que os artivírus são os únicos membros da família Totiviridae que apresentam os sítios de clivagem 2A-like e duas proteínas previamente preditas para o IMNV. Um possível sítio de clivagem upstream à proteína do capsídeo também foi identificado nesses genomas. Modelos proteicos revelaram estruturas conservadas para as duas proteínas, indicando que, provavelmente, elas estão envolvidas na formação das protrusões virais e empacotamento do RNA. O capítulo 2 aborda o sequenciamento e análise do genoma de um isolado brasileiro do WSSV (WSSV-BR). O genoma foi sequenciado utilizando a plataforma Ion Torrent e montado usando um pipeline alternativo no qual um genoma quimera do WSSV foi utilizado como sequência referência. O genoma do WSSV-BR apresentou um tamanho de 292.912 pb, 184 possíveis ORFs e nove regiões homólogas (hrs). Análises de identidade e de filogenia mostraram que o WSSV brasileiro é mais próximo aos isolados da Tailândia e México e que, provavelmente, esses três vírus compartilham uma origem evolutiva comum. Além disso, foi observado que a história evolutiva do WSSV pode estar relacionada a eventos de recombinação e que esses eventos, de algum modo, podem ser traçados analisando as regiões homólogas do WSSV. O capítulo 3 traz o sequenciamento e análise de uma possível nova variante brasileira do PstDNV (PstDNV-BR17), a qual não causa sintomas nos camarões em campo. A comparação de identidade e a análise filogenética mostraram que o novo isolado faz parte da linhagem infecciosa do PstDNV, o que foi inesperado. Análises de estrutura secundária e terciária das proteínas virais também não mostraram diferenças entre os isolados brasileiros. Entretanto, os resultados da análise da região 5’UTR revelaram peculiaridades que sugerem que esta região pode estar envolvida nos mecanismos de virulência do PstDNV, o que explicaria a diferença observada em campo. Todos esses resultados em conjunto contribuem para aumentar o conhecimento sobre os principais vírus que acometem a carcinicultura mundial.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1880243 - DANIEL CARLOS FERREIRA LANZA
Interno - 2275890 - MARCELO DE SOUSA DA SILVA
Externo à Instituição - RUBENS GALDINO FEIJÓ - IFCE
Externo à Instituição - SUZIANNY MARIA BZERRA CABRAL DA SILVA
Interna - 1674709 - VIVIANE SOUZA DO AMARAL