Banca de QUALIFICAÇÃO: GABRIELA SALVADOR OURIQUE

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : GABRIELA SALVADOR OURIQUE
DATA : 14/12/2017
HORA: 14:00
LOCAL: Sala Carl Peter von Dietrich - Departamento de Bioquímica
TÍTULO:

Estudo in silico da interação da protease NS3-NS2B de diferentes flavivírus

com um inibidor peptídico.

PALAVRAS-CHAVES:

WNV, NS3-NS2B, Flavivirus, DFT, Inibidor, modelagem molecular

PÁGINAS: 76
RESUMO:

Flaviviridae é uma grande família de patógenos virais responsáveis por diversas doenças e por grande mortalidade de pessoas no mundo todo. Dengue, Zika, Febre do oeste do Nilo, Febre Amarela (FA), Hepatite C (HC) e Encefalite Japonesa (EJ) dentre outras, são doenças infecciosas, membros dessa família. A maioria dessas infecções não possui vacinas comercializadas e nem drogas antivirais, sendo o tratamento apenas sintomático e de combate ao inseto vetor. Tais infecções apresentam um genoma muito semelhante. Muitos grupos de pesquisa têm se dedicado a encontrar uma molécula inibidora específica a algumas proteínas virais essenciais a replicação. Com o avanço das técnicas de modelagem molecular, aliando-se aos crescentes trabalhos in vivo, este trabalho visa estudar a inibição da protease NS3-NS2B de Febre do Nilo Ocidental e Zika. Destacando-se as semelhanças e diferenças entre os mecanismos de inibição das proteínas NS3 para cada vírus. O inibidor tetrapeptídico Bz-Nle-Lys-Arg-Arg-H, com uma alta constante de inibição, tem sido apresentado na literatura como um potente inibidor da protease NS3 de diversos Flavivirus. Sendo uma estratégia inteligente para o tratamento de infeções causadas por esta família viral. O presente trabalho objetivou estudar as interações do ligante junto ao sítio ativo para fornecer uma visão mais clara e aprofundada dessas interações. Para tal desenvolveu-se um estudo in silico, com utilização de cálculos de mecânica quântica, baseada na Teoria do Funcional da Densidade (DFT). A energia de interação de cada aminoácido do sítio de ligação, com o ligante será calculada com base no método de fragmentação molecular com capas conjugadas (MFCC). Além da energia, serão calculadas as distâncias, tipos de interações moleculares e grupos atômicos envolvidos. Os resultados parciais para Febre do Oeste do Nilo demonstraram que o inibidor possui uma boa afinidade com o sítio ativo da protease NS3-NS2B para ambos os vírus. Sendo, portanto um bom candidato a tratamento antiviral específico aos Flavivirus. O trabalho também apresentou a lista dos resíduos mais importantes para a ligação inibidor-receptor. Isto é, os resíduos de aminoácidos que mais contribuem e os que menos favorecem a esta interação.

MEMBROS DA BANCA:
Externo ao Programa - 1645202 - ELAINE CRISTINA GAVIOLI
Externo ao Programa - 1379465 - GILBERTO CORSO
Presidente - 2195251 - HUGO ALEXANDRE DE OLIVEIRA ROCHA