Banca de QUALIFICAÇÃO: NATHALIA MAÍRA CABRAL DE MEDEIROS

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : NATHALIA MAÍRA CABRAL DE MEDEIROS
DATA : 09/10/2017
HORA: 14:00
LOCAL: carl von dietrich
TÍTULO:

IDENTIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DE COMPONENTES DA VIA DE EXCISÃO DE BASES (BER) EM CANA-DE-AÇÚCAR (SACCHARUM spp.).


PALAVRAS-CHAVES:

Reparo de DNA, AP Endonuclease, cana-de-açúcar, caracterização bioquímica, Filogenia, Modelagem.


PÁGINAS: 250
RESUMO:

A produtividade de qualquer cultivar está diretamente relacionada com a estabilidade de seu genoma, desta forma se este sofre algum dano ou alteração em sua sequência pode acarretar consequências graves, afetando diretamente seu desenvolvimento/crescimento. A resposta ao reparo do DNA consiste em diferentes vias sendo uma delas a via de excisão de bases (BER), cujos estudos em plantas são relativamente recentes. Um dos obstáculos nos avanços da pesquisa seria a complexidade do genoma vegetal presente em alguns cultivares de importância agroeconômica - a exemplo da cana-de-açúcar- de modo que muitos ensaios e estudos utilizam organismos modelos diploides. ScARP1, trata-se de uma sequência homóloga a Ap endonuclease de Arabidosis thaliana (AtARP), uma enzima essencial da via BER. Este trabalho propõe preencher uma lacuna existente no conhecimento associado a plantas, em especial para os estudos de caracterização enzimática em cana-de-açúcar. E uma segunda abordagem utilizada foi de identificar outros componentes da via BER em cana-de-açúcar para o aprofundamento na questão da conservação desta via entre os grupos de organismos vegetais, retendo um foco especial na família Poaceae. Para a primeira abordagem, a proteína ScARP1 foi clonada, expressa e purifica, para depois ser alvo de diferentes ensaios que visavam avaliar a sua eficiência enzimática (considerando temperatura, cofatores enzimáticos e concentração de sais), assim como os substratos que seriam reconhecidos por esta enzima. Foi observado que a Ap endonuclease de cana-de-açúcar possui apenas atividade AP endonuclease uma vez que não reconheceu outros subtratos. Além disso, também foi examinado a existência da complementação enzimática com ScARP1 em extratos de A. thalina mutante arp-/-, onde foi observado uma complementação parcial. Para a segunda abordagem deste trabalho, foi considerando os resultados anteriores, onde foi verificado uma duplicação em cana-de-açúcar para a sequência AP endonuclease (ScARP1 e ScARP3). Com base nestes resultados foi feito uma busca por sequências de referência da via BER no banco de dados do UniProt. Estas foram utilizadas como base para efetuar buscas nos bancos de dados de sequências para cana-de-açúcar: DFCI e SUCEST. Os resultados dessa busca foram alinhados com outras sequências de organismos vegetais provenientes do Phytozome, com o intuito de encontrar duplicações para outras proteínas componentes dessa via. As sequências encontradas foram caracterizadas quanto a presença de domínios conservados, além de algumas delas foram empregadas em analises filogenéticas e utilizadas no processo de modelagem, criando modelos hipotéticos que ainda estão em andamento. Os resultados obtidos com este trabalho ampliam um pouco mais sobre genes de reparo da via BER em cana-de-açúcar, e estes resultados poderão num futuro serem utilizados como ferramentas biotecnológicas para o manejo deste cultivar de importância mundial para a produção de açúcar e biocombustível


MEMBROS DA BANCA:
Interno - 1880243 - DANIEL CARLOS FERREIRA LANZA
Externo ao Programa - 1893445 - EUZEBIO GUIMARAES BARBOSA
Presidente - 1513597 - JOAO PAULO MATOS SANTOS LIMA
Notícia cadastrada em: 18/09/2017 10:04
SIGAA | Superintendência de Tecnologia da Informação - (84) 3342 2210 | Copyright © 2006-2024 - UFRN - sigaa04-producao.info.ufrn.br.sigaa04-producao