Investigando a a taxonomia de Enterococcus casseliflavus e Especies Relacionadas
Enterococcus; Taxonomia; ANI; Pangenoma
Enterococcus casseliflavus, uma bactéria comumente móvel e de coloração amarela, é um membro comensal do trato gastrointestinal. Ela é ocasionalmente encontrada em casos de bacteremia e outras infecções humanas. Uma preocupação é que todas as cepas dessa espécie possuem o grupo de genes vanC em seu cromossomo, que confere resistência à vancomicina. A classificação de E. casseliflavus é desafiadora, pois apresenta 99% de identidade na análise 16S com E. gallinarum e, principalmente, com E. flavescens, sendo frequentemente classificadas como uma única espécie. Esse estudo visou investigar a taxonomia de E. casseliflavus e outras espécies relacionadas realizando análises dos dados genômicos disponíveis em bancos de dados públicos. Para isso, 155 genomas de espécies relacionadas a E. casseliflavus (E. casseliflavus, E. flavescens, E. entomosocium e E. innesii) foram resgatados e submetidos a análise de Identidade Média de Nucleotídeos (ANI), análise de pangenoma e filogenomica. As abordagens mostraram três grupos bem definidos correspondentes a três espécies de Enterococcus (E. casseliflavus, E. flavescens e E. innesii). Com características de pangenoma aberto, o grupo mostrou grande conservação de genes centrais e alta diversidade de genoma acessório. Aqui sugerimos a remoção do estado de espécies sinônimas entre as espécies E. flavescens e E. casseliflavus e a adição do estado de espécies sinônimas entre E. entomosocium e E. casseliflavus.