Banca de DEFESA: THAIS TEIXEIRA OLIVEIRA

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : THAIS TEIXEIRA OLIVEIRA
DATA : 30/10/2024
HORA: 14:00
LOCAL: Google Meet (link: https://meet.google.com/qed-sbdc-boh)
TÍTULO:

Transcriptômica da COVID-19: Identificação de potenciais biomarcadores e Mecanismos Moleculares da gravidade da doença.

PALAVRAS-CHAVES:

SARS-CoV-2, RNA-seq, Resposta imunológica, Biomarcadores, Fatores de transcrição.

 

PÁGINAS: 135
RESUMO:

Durante a pandemia da COVID-19, estudos de transcriptoma foram produzidos com o objetivo de investigar possíveis mecanismos de resposta imunológica ao SARS-CoV-2, descobrir possíveis alvos de tratamento, elucidar a relação vírus-hospedeiro e elencar biomarcadores da doença. No entanto, muitos desses dados permanecem subutilizados e alguns podem possuir um número limitado de pacientes avaliados. Fazendo com que uma grande variedade de resultados fosse observada e poucos fossem refletidos em pesquisas futuras. Para melhorar a busca por alvos moleculares e biomarcadores, este trabalho avaliou a literatura gerada durante a pandemia na área de transcriptômica e seus principais resultados. Neste estudo foram analisados 203 artigos publicados que realizaram experimentos de transcriptômica em pacientes infectados pelo SARS-CoV-2 e controles não infectados. Estes trabalhos destacaram a desregulação de genes estimulados por interferon (ISGs), citocinas e quimiocinas e genes relacionados a ativação de neutrófilos. Além disso, também foi realizada uma reanálise integrada de vários conjuntos de dados de RNA-seq disponíveis em bancos de dados públicos. Esta análise possibilitou o aumento do número de pacientes avaliados, aumentando a confiabilidade dos dados e a variabilidade genética, incluindo pacientes de diferentes países. Este trabalho se concentra na análise de conjuntos de dados de pacientes com COVID-19 grave e leve para identificar possíveis alvos ou vias associadas à progressão da doença e descobrir biomarcadores de gravidade. Foram analisados três conjuntos de dados de sangue total e um conjunto de dados de amostras de leucócitos de pacientes na unidade de terapia intensiva (UTI) comparando-os com pacientes de UTI, porém negativos para COVID-19. Além disso, dados de swab nasal e PBMC também foram analisados. Como resultado, foi observado que pacientes graves com COVID-19 exibem superexpressão de genes que codificam proteínas de exossomos extracelulares, proteínas do sistema de endomembranas e grânulos de neutrófilos. Além disso, foram destacados alvos-chave como S100A9, LY96, GAPDH, RAB1B, NFKBIA e CD63 que podem desempenhar um papel importante na resposta celular à infecção. Por outro lado, pacientes com COVID-19 grave apresentam regulação negativa de genes que codificam componentes do complexo receptor de células T e proteínas do nucléolo, incluindo TP53, IL2RB e NCL. Finalmente, a análise de predição de reguladores master, considerando o conjunto de genes up e downregulados mostrou que o SPI1 é um fator de transcrição associado aos genes positivamente regulados e TP53, MYC e MAX têm um papel essencial na regulação da expressão dos genes regulados negativamente durante o COVID-19. Por fim os genes destacados foram avaliados em soro de pacientes COVID- 19 leves e graves a fim de validar biomarcadores testáveis em soro. Vários desses genes não foram citados em trabalhos anteriores o que indica que este trabalho identificou alvos importantes que podem estimular insights sobre a compreensão da fisiopatologia molecular da infecção por SARS-CoV-2. Além disso, a identificação de fatores transcricionais que regulam a expressão de genes envolvidos na infecção e na resposta inflamatória pode ser fundamental para o avanço da compreensão da doença e para a busca por novos alvos terapêuticos.

 

MEMBROS DA BANCA:
Externo à Instituição - GLORIA REGINA FRANCO - UFMG
Externo ao Programa - 1715230 - JOSELIO MARIA GALVAO DE ARAUJO - nullPresidente - 1149647 - LUCYMARA FASSARELLA AGNEZ LIMA
Interna - 1199127 - SILVIA REGINA BATISTUZZO DE MEDEIROS
Externo à Instituição - ÂNDREA KELY CAMPOS RIBEIRO DOS SANTOS - UFPA