SIGAA - Sistema Integrado de Gestão de Atividades Acadêmicas

Resumo do Componente Curricular

Dados Gerais do Componente Curricular
Tipo do Componente Curricular:	MÓDULO
Unidade Responsável:	PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOINFORMÁTICA - IMD (11.00.05.02.03.05)
Código:	BIF0052
Nome:	FILOGENIA MOLECULAR
Carga Horária Teórica:	30 h.
Carga Horária Prática:	0 h.
Carga Horária de Ead:	0 h.
Carga Horária Total:	30 h.
Pré-Requisitos:
Co-Requisitos:
Equivalências:
Excluir da Avaliação Institucional:	Não
Matriculável On-Line:	Sim
Método de Avaliação:	CONCEITO
Horário Flexível da Turma:	Não
Horário Flexível do Docente:	Sim
Obrigatoriedade de Nota Final:	Sim
Pode Criar Turma Sem Solicitação:	Não
Necessita de Orientador:	Não
Exige Horário:	Sim
Permite CH Compartilhada:	Não
Permite Múltiplas Aprovações:	Não
Quantidade de Avaliações:	1
Ementa/Descrição:	Conceitos Básicos de evolução de sequências biológicas. Marcadores filogenéticos. Árvores filogenéticas e o Tree Thinking. Alinhamento múltiplo de sequências (MSA). Estimando saturação de substituições. Teste do modelo de substituição. Inferências Filogenéticas. Métodos de distância. Máxima Parcimônia. Máxima verossimilhança. Testes de confiança em topologias. Testes de seleção em sequências codificantes. Inferência Bayesiana. Análise de convergência. Estimando taxas de evolução a partir de datas. Filogenômica. Construíndo e Interpretando EBSPs (Extended Bayesian Skyline Plots.). Filogenias não-bifurcadas - Split networks.
Referências:	- Higgs, P.G.; Attwood, T.K. Bioinformatics and Molecular Evolution.. Malden (Massachusetts): Blackwell Publishing. 2005. - Choudhuri S. Bioinformatics for Beginners: Genes, Genomes, Molecular Evolution, Databases and Analytical Tools. Elsevier, 2014. - Futuyma DJ. Evolution. Sunderland, Massachusetts, USA.: Sinauer Associates; 2nd Edition. 2009. - Graur, d. & Li, W. H. Fundamentals of Molecular Evolution. 2a edição. Sinauer Press, Sunderland, Massachusetts. 2000. 481p. - Hedges, S. B.; Kumar, S. (Eds). The timetree of life. Oxford University Press, New York. 2009. - Lemey, P., Salemi, M., Vandamme, A. (eds.). The Phylogenetic Handbook: a Practical Approach to Phylogenetic Analysis and Hypothesis Testing, Published by Cambridge University Press. Cambridge University Press 2009. - Nei, M. & Kumar, S. Molecular Evolution and Phylogenetics. Oxford University Press, Inc. 2001. 333p. - Page, R. D. M. & Holmes, E. C. Molecular Evolution: A phylogenetic approach. Blackwell Science. 2001. 346 pp. - Xia, X. 2000. Data Analysis in Molecular Biology and Evolution. Kluwer Academic Publishers.

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