| Ementa/Descrição: |
I - EMENTA:
Através de textos avançados serão abordados temas relacionados a necessidade da utilização da informática em diversas etapas de investigação estrutural de DNA, RNA e proteínas. A utilização da internet: bancos de dados disponíveis (Genebank, EMBL, PIR, PDB, etc) sites de interesse para busca de informações sobre bioquímica e biologia molecular.
II – Objetivos
Esta disciplina pretende fornecer ao aluno uma visão da utilização de técnicas de informática para a análise de dados relativos à genômica e de estrutura/função de proteínas.
III - Conteúdos teórico/práticos:
1. Introdução a sequências de biomoléculas;
2. Técnicas de mapeamento, estudo sobre homologia e alinhamento, visualização de sequências;
3. Introdução básica a estudos genômicos e utilização de programas computacionais adequados;
4. Terminologia e aspectos de uso de programas para mapeamento genômico em alta e baixa resolução e seqüenciamento de genes;
5. A informática nos estudos de estrutura e função de proteínas;
6. Programas para análise de homologia de seqüências e de visualização de moléculas protéicas;
7. O pós genoma: a elucidação do genoma de um organismo e a comparação com outras espécies;
8. Relação entre o genoma, à expressão de proteínas e o controle metabólico;
9. Correlação entre as estruturas de proteínas e sua função a partir dos dados processados por técnicas de bioinformática;
VI - Procedimentos Metodológicos
• O conteúdo desta disciplina será ministrado através de aulas teóricas e demonstrações: realização de exercícios práticos relativos ao programa serão incentivados e deverão ser executados em local e período de preferência de cada aluno.
V - Procedimentos de Avaliação
• Relatório final envolvendo questões relativas aos tópicos abordados, procurando avaliar a capacidade do aluno com aspectos práticos do uso da bioinformática.
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| Referências: |
1. Bioinformatics: sequence and genome analysis. David W. Mount. Editora Cold Spring Harbor Laboratory Press; 2nd edition. 2004.
2. Developing bioinformatics computer skills. Cynthia Gibas e Per Jambeck. Editora O'Reilly Media, Inc., 1 edition , 2001.
3. Bioinformatics: A practical guide to the analysis of gene and proteins. Third Edition. Andreas D. Baxevanis (Editor), B.F.Francis Quellett (Editor). Editora Wiley-Interscience, 3 edition, 2004.
4. Understanding Bioinformatics. Marketa Zvelebil, Jeremy O. Baum. 1st Edition, Garland Science, 2007.
5. Basics of Bioinformatics: Lecture Notes of the Graduate Summer School on Bioinformatics of China. Rui Jiang, Michael Q. Zhang, Xuegong Zhang, Springer; Softcover reprint of the original 1st ed. 2013 edição (23 agosto 2016).
6. Bioinformatics: A Practical Handbook of Next Generation Sequencing and Its Applications. Loyd Wai Vee Low, Martti Tapani Tammi, Editora WSPC, 2017.
7. Introduction to Bioinformatics. Arthur Lesk. Oxford University Press, USA; 5th ed. Edição, 2019.
8. Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins. Andreas D. Baxevanis, Gary D. Bader, e outros. Wiley; 4ª edição, 2020
9.Artigos científicos publicados em revistas renomadas que tragam informações relevantes e atuais sobre os temas discutidos.
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