SIGAA - Sistema Integrado de Gestão de Atividades Acadêmicas

Resumo do Componente Curricular

Dados Gerais do Componente Curricular
Tipo do Componente Curricular:	MÓDULO
Unidade Responsável:	PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOINFORMÁTICA - IMD (11.00.05.02.03.05)
Curso:	MESTRADO EM BIOINFORMÁTICA/PPGBIONF - NATAL
Código:	BIF0020
Nome:	PROCESSAMENTO E ANÁLISE DE NGS
Carga Horária Teórica:	30 h.
Carga Horária Prática:	0 h.
Carga Horária de Ead:	0 h.
Carga Horária Total:	30 h.
Pré-Requisitos:
Co-Requisitos:
Equivalências:
Excluir da Avaliação Institucional:	Não
Matriculável On-Line:	Sim
Método de Avaliação:	CONCEITO
Horário Flexível da Turma:	Não
Horário Flexível do Docente:	Sim
Obrigatoriedade de Nota Final:	Sim
Pode Criar Turma Sem Solicitação:	Não
Necessita de Orientador:	Não
Exige Horário:	Sim
Permite CH Compartilhada:	Não
Permite Múltiplas Aprovações:	Não
Quantidade de Avaliações:	1
Ementa/Descrição:	Utilização de ferramentas de bioinformática na análise de sequências proveniente de sequenciadores de segunda geração. Alinhamento de sequências biológicas provenientes de experimentos de RNAseq, exomas e genomas completos. Algoritmos de alinhamento de sequências. Busca de similaridade em Bancos e Dados Biológicos. Montagem de Sequências Biológicas. Reconhecimento de Padrões e assinaturas em Sequências. Identificação de Genes, de Promotores e de Regiões Reguladoras por sequenciamento. Anotação de Genes. Chamada de Polimorfismos e mutações somáticas. Cálculo de Distâncias entre sequências. Analise de expressão diferencial. Métodos de agrupamento.
Referências:	1) MOUNT, D. Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis. New York: Cold Spring Habor Press, 2004. 692p. 2) R. Durbin and S. Eddy and A. Krogh and G. Mitchison, Biological Sequence Analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids. Cambridge University Press. 1998. 3) Eija Korpelainen, Jarno Tuimala, Panu Somervuo, Mikael Huss, Garry Wong. RNA-seq Data Analysis: A Practical Approach. 2014 4) Naiara Rodríguez-Ezpeleta, Michael Hackenberg, Ana M. Aransay. Bioinformatics for High Throughput Sequencing. 2011. 5) Stuart M. Brown. (2013) Next-Generation DNA Sequencing Informatics. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor: New York. 256. ISBN-10: 1936113872. 6) Jianping Xu. (2014) Next-generation Sequencing: Current Technologies and Applications. Caister Academic Press, EUA. ISBN-13: 978-1908230331.

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