Dados Gerais do Componente Curricular
| Tipo do Componente Curricular: |
MÓDULO |
| Unidade Responsável: |
PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOINFORMÁTICA - IMD (11.00.05.02.03.05) |
| Código: |
BIF0016 |
| Nome: |
ALGORITMOS EM BIOINFORMÁTICA |
| Carga Horária Teórica: |
30 h. |
| Carga Horária Prática: |
0 h. |
| Carga Horária de Ead: |
0 h. |
| Carga Horária Total: |
30 h. |
| Pré-Requisitos: |
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| Co-Requisitos: |
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| Equivalências: |
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| Excluir da Avaliação Institucional: |
Não |
| Matriculável On-Line: |
Sim |
| Horário Flexível da Turma: |
Não |
| Horário Flexível do Docente: |
Sim |
| Obrigatoriedade de Nota Final: |
Sim |
| Pode Criar Turma Sem Solicitação: |
Não |
| Necessita de Orientador: |
Não |
| Exige Horário: |
Sim |
| Permite CH Compartilhada: |
Não |
| Quantidade de Avaliações: |
1 |
| Ementa/Descrição: |
Alinhamento de pares sequências, Avaliação de alinhamentos (significado biológico dos alinhamentos, matrizes de substituição, e-values), Algoritmos de alinhamento (alinhamento local, global e semi-global, alinhamento com modelos mais complexos), Alinhamento de mRNAs contra sequências genômicas. Predição de genes, caracterização de famílias de sequências, HMMER e PFAM, Alinhamento de genomas; Alinhamentos múltiplos, Programação dinâmica multidimensional, Avaliação de alinhamentos múltiplos, Uso de alinhamentos múltiplos para construir filogenias moleculares Análise de RNAs, Predição de estrutura secundária, Busca de motivos em sequências, caracterização de estruturas de RNA. |
| Referências: |
1) David Mount, Bioinformatics, Seg. Edição, Cold Spring Harbor, 2004
2) Neil C. Jones e Pavel A. Pevzner: An Introduction to Bioinformatics Algorithms, MIT Press, 2004
3 R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchison: Biological Sequence Analysis: probabilistic models of proteins and nucleic acids, Cambridge Press, 1998
4) Wing-Kin Sung: Algorithms in Bionformatics: A practical introduction, CRC Press, 2009. |
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