SIGAA - Sistema Integrado de Gestão de Atividades Acadêmicas

Resumo do Componente Curricular

Dados Gerais do Componente Curricular
Tipo do Componente Curricular:	MÓDULO
Unidade Responsável:	PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOINFORMÁTICA - IMD (11.00.05.02.03.05)
Código:	BIF0009
Nome:	EVOLUÇÃO MOLECULAR
Carga Horária Teórica:	30 h.
Carga Horária Prática:	0 h.
Carga Horária de Ead:	0 h.
Carga Horária Total:	30 h.
Pré-Requisitos:
Co-Requisitos:
Equivalências:
Excluir da Avaliação Institucional:	Não
Matriculável On-Line:	Sim
Horário Flexível da Turma:	Não
Horário Flexível do Docente:	Sim
Obrigatoriedade de Nota Final:	Sim
Pode Criar Turma Sem Solicitação:	Sim
Necessita de Orientador:	Não
Exige Horário:	Sim
Permite CH Compartilhada:	Não
Quantidade de Avaliações:	1
Ementa/Descrição:	Aspectos históricos. Bases teóricas da Genética de populações. Sequenciamento de proteínas. O relógio molecular. Teoria neutralista da evolução molecular. Homologia e similaridade de macromoléculas. Algoritmos de busca por similaridade. Organização e peculiaridades dos bancos de dados. Alinhamento par a par e múltiplo de sequências macromoleculares. Algoritmos de alinhamento local. Uso de estrutura secundária. Comparação de estruturas tridimensionais. Taxas de evolução molecular. Restrições evolutivas. Origem e evolução de genes. Reconstrução de filogenias moleculares. Métodos baseados em matrizes de distâncias. Modelos de substituição. Algoritmos de construção de árvores. Algoritmos de minimização de erro. O método de parcimônia. Algoritmos de busca. Variações do método de parcimônia. Estatísticas associadas à parcimônia ("bootstrap", "jacknife", sustentação de ramos). O método da máxima verossimilhança. Escolha de modelos de substituição. Teste de hipóteses na verossimilhança. Métodos Bayesianos de inferência filogenética.
Referências:	1) Wiley, E.O.; Lieberman, B. S. Phylogenetics: Theory and Practice of Phylogenetics Systematics. John Wiley & Sons. 2011. 2) Lemey, P.; Salemi, M. The Phylogenetic Handbook: A Practical Approach to Phylogenetic Analysis and Hypothesis Testing. Cambridge University Press; 2nd edition. 2009. 3) FUTUYMA, D. J. Evolution. Sunderland, Massachusetts, USA.: Sinauer Associates, 2005. 618 p. 4) Paradis, E. Analysis of Phylogenetics and Evolution with R. Springer; 2nd ed. 2012. 5) Chen, M.; Kuo, L. Bayesian Phylogenetics: Methods, Algorithms, and Applications (Chapman & Hall/CRC Mathematical and Computational Biology). 2014. 6) Higgs, P.G.; Attwood, T. K. Bioinformatics and Molecular Evolution. 1. ed. Oxford, UK.: Blackwell, 2005. 7) Patthy, L. Protein Evolution. Wiley-Blackwell. 2 ed. 2007.

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