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Universidade Federal do Rio Grande do Norte Natal, 04 de Abril de 2025

Resumo do Componente Curricular

Dados Gerais do Componente Curricular
Tipo do Componente Curricular: MÓDULO
Unidade Responsável: PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOINFORMÁTICA - IMD (11.00.05.02.03.05)
Código: BIF0009
Nome: EVOLUÇÃO MOLECULAR
Carga Horária Teórica: 30 h.
Carga Horária Prática: 0 h.
Carga Horária de Ead: 0 h.
Carga Horária Total: 30 h.
Pré-Requisitos:
Co-Requisitos:
Equivalências:
Excluir da Avaliação Institucional: Não
Matriculável On-Line: Sim
Método de Avaliação: CONCEITO
Horário Flexível da Turma: Não
Horário Flexível do Docente: Sim
Obrigatoriedade de Nota Final: Sim
Pode Criar Turma Sem Solicitação: Sim
Necessita de Orientador: Não
Exige Horário: Sim
Permite CH Compartilhada: Não
Permite Múltiplas Aprovações: Não
Quantidade de Avaliações: 1
Ementa/Descrição: Aspectos históricos. Bases teóricas da Genética de populações. Sequenciamento de proteínas. O relógio molecular. Teoria neutralista da evolução molecular. Homologia e similaridade de macromoléculas. Algoritmos de busca por similaridade. Organização e peculiaridades dos bancos de dados. Alinhamento par a par e múltiplo de sequências macromoleculares. Algoritmos de alinhamento local. Uso de estrutura secundária. Comparação de estruturas tridimensionais. Taxas de evolução molecular. Restrições evolutivas. Origem e evolução de genes. Reconstrução de filogenias moleculares. Métodos baseados em matrizes de distâncias. Modelos de substituição. Algoritmos de construção de árvores. Algoritmos de minimização de erro. O método de parcimônia. Algoritmos de busca. Variações do método de parcimônia. Estatísticas associadas à parcimônia ("bootstrap", "jacknife", sustentação de ramos). O método da máxima verossimilhança. Escolha de modelos de substituição. Teste de hipóteses na verossimilhança. Métodos Bayesianos de inferência filogenética.
Referências: 1) Wiley, E.O.; Lieberman, B. S. Phylogenetics: Theory and Practice of Phylogenetics Systematics. John Wiley & Sons. 2011. 2) Lemey, P.; Salemi, M. The Phylogenetic Handbook: A Practical Approach to Phylogenetic Analysis and Hypothesis Testing. Cambridge University Press; 2nd edition. 2009. 3) FUTUYMA, D. J. Evolution. Sunderland, Massachusetts, USA.: Sinauer Associates, 2005. 618 p. 4) Paradis, E. Analysis of Phylogenetics and Evolution with R. Springer; 2nd ed. 2012. 5) Chen, M.; Kuo, L. Bayesian Phylogenetics: Methods, Algorithms, and Applications (Chapman & Hall/CRC Mathematical and Computational Biology). 2014. 6) Higgs, P.G.; Attwood, T. K. Bioinformatics and Molecular Evolution. 1. ed. Oxford, UK.: Blackwell, 2005. 7) Patthy, L. Protein Evolution. Wiley-Blackwell. 2 ed. 2007.

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